Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXC5

MIOS, GATOR complex protein MIOS, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIOSQ9NXC5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MIOSQ9NXC5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MIOSQ9NXC5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MIOSQ9NXC5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MIOSQ9NXC5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MIOSQ9NXC5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MIOSQ9NXC5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MIOSQ9NXC5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MIOSQ9NXC5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MIOSQ9NXC5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MIOSQ9NXC5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MIOSQ9NXC5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MIOSQ9NXC5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MIOSQ9NXC5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MIOSQ9NXC5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MIOSQ9NXC5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MIOSQ9NXC5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MIOSQ9NXC5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MIOSQ9NXC5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MIOSQ9NXC5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MIOSQ9NXC5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MIOSQ9NXC5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MIOSQ9NXC5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MIOSQ9NXC5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MIOSQ9NXC5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MIOSQ9NXC5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MIOSQ9NXC5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MIOSQ9NXC5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MIOSQ9NXC5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MIOSQ9NXC5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MIOSQ9NXC5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MIOSQ9NXC5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MIOSQ9NXC5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MIOSQ9NXC5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MIOSQ9NXC5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MIOSQ9NXC5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MIOSQ9NXC5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MIOSQ9NXC5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MIOSQ9NXC5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MIOSQ9NXC5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MIOSQ9NXC5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MIOSQ9NXC5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MIOSQ9NXC5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MIOSQ9NXC5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MIOSQ9NXC5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MIOSQ9NXC5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MIOSQ9NXC5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MIOSQ9NXC5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MIOSQ9NXC5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MIOSQ9NXC5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MIOSQ9NXC5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MIOSQ9NXC5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MIOSQ9NXC5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MIOSQ9NXC5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MIOSQ9NXC5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MIOSQ9NXC5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MIOSQ9NXC5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MIOSQ9NXC5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MIOSQ9NXC5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MIOSQ9NXC5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MIOSQ9NXC5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MIOSQ9NXC5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MIOSQ9NXC5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MIOSQ9NXC5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MIOSQ9NXC5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MIOSQ9NXC5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MIOSQ9NXC5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MIOSQ9NXC5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MIOSQ9NXC5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MIOSQ9NXC5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MIOSQ9NXC5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MIOSQ9NXC5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MIOSQ9NXC5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MIOSQ9NXC5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MIOSQ9NXC5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MIOSQ9NXC5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MIOSQ9NXC5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MIOSQ9NXC5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MIOSQ9NXC5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MIOSQ9NXC5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MIOSQ9NXC5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MIOSQ9NXC5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MIOSQ9NXC5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MIOSQ9NXC5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MIOSQ9NXC5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MIOSQ9NXC5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MIOSQ9NXC5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MIOSQ9NXC5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MIOSQ9NXC5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MIOSQ9NXC5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MIOSQ9NXC5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MIOSQ9NXC5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MIOSQ9NXC5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MIOSQ9NXC5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MIOSQ9NXC5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MIOSQ9NXC5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MIOSQ9NXC5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MIOSQ9NXC5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MIOSQ9NXC5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MIOSQ9NXC5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.8 ms