Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RLIMQ9NVW2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RLIMQ9NVW2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RLIMQ9NVW2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RLIMQ9NVW2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLIMQ9NVW2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLIMQ9NVW2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLIMQ9NVW2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLIMQ9NVW2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLIMQ9NVW2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLIMQ9NVW2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RLIMQ9NVW2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RLIMQ9NVW2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RLIMQ9NVW2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RLIMQ9NVW2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RLIMQ9NVW2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RLIMQ9NVW2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RLIMQ9NVW2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RLIMQ9NVW2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RLIMQ9NVW2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RLIMQ9NVW2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RLIMQ9NVW2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RLIMQ9NVW2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RLIMQ9NVW2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RLIMQ9NVW2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RLIMQ9NVW2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RLIMQ9NVW2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RLIMQ9NVW2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RLIMQ9NVW2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RLIMQ9NVW2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RLIMQ9NVW2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RLIMQ9NVW2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RLIMQ9NVW2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RLIMQ9NVW2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RLIMQ9NVW2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RLIMQ9NVW2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RLIMQ9NVW2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLIMQ9NVW2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RLIMQ9NVW2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLIMQ9NVW2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLIMQ9NVW2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLIMQ9NVW2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLIMQ9NVW2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RLIMQ9NVW2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLIMQ9NVW2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLIMQ9NVW2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLIMQ9NVW2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLIMQ9NVW2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLIMQ9NVW2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLIMQ9NVW2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RLIMQ9NVW2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLIMQ9NVW2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLIMQ9NVW2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLIMQ9NVW2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLIMQ9NVW2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLIMQ9NVW2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLIMQ9NVW2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLIMQ9NVW2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLIMQ9NVW2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLIMQ9NVW2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLIMQ9NVW2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLIMQ9NVW2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLIMQ9NVW2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLIMQ9NVW2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RLIMQ9NVW2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLIMQ9NVW2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLIMQ9NVW2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLIMQ9NVW2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLIMQ9NVW2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLIMQ9NVW2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLIMQ9NVW2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLIMQ9NVW2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLIMQ9NVW2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLIMQ9NVW2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLIMQ9NVW2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLIMQ9NVW2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLIMQ9NVW2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLIMQ9NVW2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLIMQ9NVW2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLIMQ9NVW2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLIMQ9NVW2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLIMQ9NVW2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLIMQ9NVW2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RLIMQ9NVW2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLIMQ9NVW2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLIMQ9NVW2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLIMQ9NVW2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLIMQ9NVW2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLIMQ9NVW2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLIMQ9NVW2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLIMQ9NVW2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLIMQ9NVW2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLIMQ9NVW2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLIMQ9NVW2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RLIMQ9NVW2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RLIMQ9NVW2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RLIMQ9NVW2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RLIMQ9NVW2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RLIMQ9NVW2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RLIMQ9NVW2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms