Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV44

LINC00846, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00846, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00846Q9NV44 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00846Q9NV44 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00846Q9NV44 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00846Q9NV44 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00846Q9NV44 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00846Q9NV44 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00846Q9NV44 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00846Q9NV44 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00846Q9NV44 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00846Q9NV44 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00846Q9NV44 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00846Q9NV44 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00846Q9NV44 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00846Q9NV44 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00846Q9NV44 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00846Q9NV44 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00846Q9NV44 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00846Q9NV44 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00846Q9NV44 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00846Q9NV44 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00846Q9NV44 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00846Q9NV44 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00846Q9NV44 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00846Q9NV44 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00846Q9NV44 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00846Q9NV44 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00846Q9NV44 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00846Q9NV44 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms