Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP5S1Q9NUS5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP5S1Q9NUS5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP5S1Q9NUS5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP5S1Q9NUS5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP5S1Q9NUS5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP5S1Q9NUS5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP5S1Q9NUS5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP5S1Q9NUS5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP5S1Q9NUS5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP5S1Q9NUS5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP5S1Q9NUS5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP5S1Q9NUS5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP5S1Q9NUS5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP5S1Q9NUS5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP5S1Q9NUS5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP5S1Q9NUS5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP5S1Q9NUS5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP5S1Q9NUS5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP5S1Q9NUS5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP5S1Q9NUS5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP5S1Q9NUS5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP5S1Q9NUS5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP5S1Q9NUS5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP5S1Q9NUS5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP5S1Q9NUS5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP5S1Q9NUS5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP5S1Q9NUS5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP5S1Q9NUS5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
AP5S1Q9NUS5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AP5S1Q9NUS5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP5S1Q9NUS5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP5S1Q9NUS5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP5S1Q9NUS5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP5S1Q9NUS5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP5S1Q9NUS5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP5S1Q9NUS5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP5S1Q9NUS5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP5S1Q9NUS5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP5S1Q9NUS5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP5S1Q9NUS5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP5S1Q9NUS5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP5S1Q9NUS5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP5S1Q9NUS5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP5S1Q9NUS5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP5S1Q9NUS5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP5S1Q9NUS5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP5S1Q9NUS5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP5S1Q9NUS5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP5S1Q9NUS5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP5S1Q9NUS5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP5S1Q9NUS5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP5S1Q9NUS5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP5S1Q9NUS5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP5S1Q9NUS5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP5S1Q9NUS5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP5S1Q9NUS5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms