Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC3Q9NUD5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC3Q9NUD5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC3Q9NUD5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC3Q9NUD5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC3Q9NUD5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC3Q9NUD5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC3Q9NUD5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZCCHC3Q9NUD5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZCCHC3Q9NUD5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZCCHC3Q9NUD5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZCCHC3Q9NUD5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZCCHC3Q9NUD5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZCCHC3Q9NUD5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZCCHC3Q9NUD5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZCCHC3Q9NUD5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZCCHC3Q9NUD5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZCCHC3Q9NUD5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZCCHC3Q9NUD5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZCCHC3Q9NUD5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZCCHC3Q9NUD5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZCCHC3Q9NUD5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZCCHC3Q9NUD5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZCCHC3Q9NUD5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZCCHC3Q9NUD5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZCCHC3Q9NUD5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZCCHC3Q9NUD5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZCCHC3Q9NUD5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZCCHC3Q9NUD5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZCCHC3Q9NUD5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZCCHC3Q9NUD5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZCCHC3Q9NUD5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZCCHC3Q9NUD5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZCCHC3Q9NUD5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZCCHC3Q9NUD5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZCCHC3Q9NUD5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZCCHC3Q9NUD5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZCCHC3Q9NUD5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZCCHC3Q9NUD5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZCCHC3Q9NUD5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC3Q9NUD5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC3Q9NUD5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC3Q9NUD5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC3Q9NUD5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC3Q9NUD5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZCCHC3Q9NUD5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZCCHC3Q9NUD5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZCCHC3Q9NUD5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZCCHC3Q9NUD5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZCCHC3Q9NUD5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZCCHC3Q9NUD5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZCCHC3Q9NUD5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZCCHC3Q9NUD5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZCCHC3Q9NUD5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZCCHC3Q9NUD5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZCCHC3Q9NUD5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZCCHC3Q9NUD5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZCCHC3Q9NUD5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZCCHC3Q9NUD5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZCCHC3Q9NUD5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms