Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FOXD4L1Q9NU39 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FOXD4L1Q9NU39 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FOXD4L1Q9NU39 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FOXD4L1Q9NU39 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
FOXD4L1Q9NU39 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
FOXD4L1Q9NU39 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FOXD4L1Q9NU39 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FOXD4L1Q9NU39 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FOXD4L1Q9NU39 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FOXD4L1Q9NU39 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FOXD4L1Q9NU39 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
FOXD4L1Q9NU39 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FOXD4L1Q9NU39 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FOXD4L1Q9NU39 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FOXD4L1Q9NU39 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FOXD4L1Q9NU39 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FOXD4L1Q9NU39 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
FOXD4L1Q9NU39 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FOXD4L1Q9NU39 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FOXD4L1Q9NU39 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FOXD4L1Q9NU39 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FOXD4L1Q9NU39 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FOXD4L1Q9NU39 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FOXD4L1Q9NU39 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FOXD4L1Q9NU39 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FOXD4L1Q9NU39 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FOXD4L1Q9NU39 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FOXD4L1Q9NU39 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FOXD4L1Q9NU39 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FOXD4L1Q9NU39 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FOXD4L1Q9NU39 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FOXD4L1Q9NU39 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FOXD4L1Q9NU39 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FOXD4L1Q9NU39 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FOXD4L1Q9NU39 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FOXD4L1Q9NU39 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FOXD4L1Q9NU39 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FOXD4L1Q9NU39 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FOXD4L1Q9NU39 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FOXD4L1Q9NU39 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FOXD4L1Q9NU39 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FOXD4L1Q9NU39 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FOXD4L1Q9NU39 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FOXD4L1Q9NU39 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FOXD4L1Q9NU39 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FOXD4L1Q9NU39 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FOXD4L1Q9NU39 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
FOXD4L1Q9NU39 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
FOXD4L1Q9NU39 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FOXD4L1Q9NU39 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FOXD4L1Q9NU39 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FOXD4L1Q9NU39 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
FOXD4L1Q9NU39 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FOXD4L1Q9NU39 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOXD4L1Q9NU39 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOXD4L1Q9NU39 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOXD4L1Q9NU39 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXD4L1Q9NU39 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXD4L1Q9NU39 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FOXD4L1Q9NU39 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FOXD4L1Q9NU39 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
FOXD4L1Q9NU39 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FOXD4L1Q9NU39 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FOXD4L1Q9NU39 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FOXD4L1Q9NU39 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXD4L1Q9NU39 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXD4L1Q9NU39 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXD4L1Q9NU39 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXD4L1Q9NU39 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXD4L1Q9NU39 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXD4L1Q9NU39 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXD4L1Q9NU39 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXD4L1Q9NU39 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXD4L1Q9NU39 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXD4L1Q9NU39 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
FOXD4L1Q9NU39 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FOXD4L1Q9NU39 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FOXD4L1Q9NU39 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FOXD4L1Q9NU39 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
FOXD4L1Q9NU39 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FOXD4L1Q9NU39 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FOXD4L1Q9NU39 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXD4L1Q9NU39 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXD4L1Q9NU39 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FOXD4L1Q9NU39 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXD4L1Q9NU39 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXD4L1Q9NU39 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXD4L1Q9NU39 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXD4L1Q9NU39 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXD4L1Q9NU39 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FOXD4L1Q9NU39 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FOXD4L1Q9NU39 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FOXD4L1Q9NU39 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FOXD4L1Q9NU39 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FOXD4L1Q9NU39 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FOXD4L1Q9NU39 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FOXD4L1Q9NU39 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
FOXD4L1Q9NU39 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms