Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT84Q9NSB2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT84Q9NSB2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT84Q9NSB2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT84Q9NSB2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT84Q9NSB2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT84Q9NSB2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT84Q9NSB2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT84Q9NSB2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT84Q9NSB2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT84Q9NSB2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT84Q9NSB2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT84Q9NSB2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT84Q9NSB2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT84Q9NSB2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT84Q9NSB2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT84Q9NSB2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT84Q9NSB2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT84Q9NSB2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT84Q9NSB2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT84Q9NSB2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT84Q9NSB2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT84Q9NSB2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT84Q9NSB2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT84Q9NSB2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT84Q9NSB2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT84Q9NSB2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT84Q9NSB2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT84Q9NSB2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT84Q9NSB2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT84Q9NSB2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT84Q9NSB2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT84Q9NSB2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT84Q9NSB2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT84Q9NSB2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT84Q9NSB2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT84Q9NSB2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT84Q9NSB2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT84Q9NSB2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT84Q9NSB2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT84Q9NSB2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT84Q9NSB2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT84Q9NSB2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KRT84Q9NSB2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT84Q9NSB2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT84Q9NSB2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT84Q9NSB2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT84Q9NSB2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT84Q9NSB2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT84Q9NSB2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT84Q9NSB2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT84Q9NSB2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT84Q9NSB2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT84Q9NSB2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT84Q9NSB2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT84Q9NSB2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT84Q9NSB2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT84Q9NSB2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT84Q9NSB2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT84Q9NSB2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT84Q9NSB2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT84Q9NSB2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT84Q9NSB2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT84Q9NSB2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT84Q9NSB2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms