Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS26

SPANXA1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome A, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXA1Q9NS26 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPANXA1Q9NS26 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPANXA1Q9NS26 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPANXA1Q9NS26 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPANXA1Q9NS26 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPANXA1Q9NS26 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPANXA1Q9NS26 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPANXA1Q9NS26 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPANXA1Q9NS26 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPANXA1Q9NS26 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SPANXA1Q9NS26 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPANXA1Q9NS26 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPANXA1Q9NS26 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPANXA1Q9NS26 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPANXA1Q9NS26 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPANXA1Q9NS26 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPANXA1Q9NS26 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPANXA1Q9NS26 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPANXA1Q9NS26 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPANXA1Q9NS26 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPANXA1Q9NS26 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SPANXA1Q9NS26 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPANXA1Q9NS26 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPANXA1Q9NS26 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPANXA1Q9NS26 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPANXA1Q9NS26 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPANXA1Q9NS26 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPANXA1Q9NS26 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPANXA1Q9NS26 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPANXA1Q9NS26 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPANXA1Q9NS26 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPANXA1Q9NS26 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SPANXA1Q9NS26 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPANXA1Q9NS26 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPANXA1Q9NS26 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPANXA1Q9NS26 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPANXA1Q9NS26 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SPANXA1Q9NS26 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPANXA1Q9NS26 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPANXA1Q9NS26 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPANXA1Q9NS26 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPANXA1Q9NS26 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPANXA1Q9NS26 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPANXA1Q9NS26 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPANXA1Q9NS26 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPANXA1Q9NS26 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPANXA1Q9NS26 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPANXA1Q9NS26 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPANXA1Q9NS26 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPANXA1Q9NS26 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPANXA1Q9NS26 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPANXA1Q9NS26 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPANXA1Q9NS26 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPANXA1Q9NS26 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPANXA1Q9NS26 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPANXA1Q9NS26 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPANXA1Q9NS26 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPANXA1Q9NS26 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPANXA1Q9NS26 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPANXA1Q9NS26 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPANXA1Q9NS26 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPANXA1Q9NS26 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPANXA1Q9NS26 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPANXA1Q9NS26 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPANXA1Q9NS26 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPANXA1Q9NS26 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPANXA1Q9NS26 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPANXA1Q9NS26 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPANXA1Q9NS26 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPANXA1Q9NS26 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPANXA1Q9NS26 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPANXA1Q9NS26 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPANXA1Q9NS26 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPANXA1Q9NS26 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPANXA1Q9NS26 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPANXA1Q9NS26 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPANXA1Q9NS26 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPANXA1Q9NS26 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPANXA1Q9NS26 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPANXA1Q9NS26 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPANXA1Q9NS26 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPANXA1Q9NS26 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPANXA1Q9NS26 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPANXA1Q9NS26 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPANXA1Q9NS26 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPANXA1Q9NS26 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPANXA1Q9NS26 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPANXA1Q9NS26 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPANXA1Q9NS26 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPANXA1Q9NS26 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPANXA1Q9NS26 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPANXA1Q9NS26 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPANXA1Q9NS26 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPANXA1Q9NS26 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPANXA1Q9NS26 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPANXA1Q9NS26 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPANXA1Q9NS26 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms