Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS00

C1GALT1, Glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1GALT1Q9NS00 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1GALT1Q9NS00 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1GALT1Q9NS00 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1GALT1Q9NS00 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1GALT1Q9NS00 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1GALT1Q9NS00 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C1GALT1Q9NS00 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1GALT1Q9NS00 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1GALT1Q9NS00 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1GALT1Q9NS00 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1GALT1Q9NS00 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1GALT1Q9NS00 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1GALT1Q9NS00 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1GALT1Q9NS00 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
C1GALT1Q9NS00 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1GALT1Q9NS00 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
C1GALT1Q9NS00 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1GALT1Q9NS00 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1GALT1Q9NS00 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1GALT1Q9NS00 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C1GALT1Q9NS00 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1GALT1Q9NS00 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1GALT1Q9NS00 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1GALT1Q9NS00 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1GALT1Q9NS00 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1GALT1Q9NS00 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1GALT1Q9NS00 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1GALT1Q9NS00 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1GALT1Q9NS00 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1GALT1Q9NS00 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1GALT1Q9NS00 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1GALT1Q9NS00 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1GALT1Q9NS00 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1GALT1Q9NS00 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1GALT1Q9NS00 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1GALT1Q9NS00 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1GALT1Q9NS00 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1GALT1Q9NS00 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1GALT1Q9NS00 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1GALT1Q9NS00 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1GALT1Q9NS00 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1GALT1Q9NS00 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1GALT1Q9NS00 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1GALT1Q9NS00 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1GALT1Q9NS00 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1GALT1Q9NS00 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1GALT1Q9NS00 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1GALT1Q9NS00 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1GALT1Q9NS00 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1GALT1Q9NS00 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1GALT1Q9NS00 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1GALT1Q9NS00 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1GALT1Q9NS00 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1GALT1Q9NS00 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
C1GALT1Q9NS00 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1GALT1Q9NS00 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1GALT1Q9NS00 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1GALT1Q9NS00 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1GALT1Q9NS00 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1GALT1Q9NS00 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1GALT1Q9NS00 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1GALT1Q9NS00 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
C1GALT1Q9NS00 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1GALT1Q9NS00 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1GALT1Q9NS00 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1GALT1Q9NS00 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1GALT1Q9NS00 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1GALT1Q9NS00 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1GALT1Q9NS00 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1GALT1Q9NS00 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1GALT1Q9NS00 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1GALT1Q9NS00 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1GALT1Q9NS00 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C1GALT1Q9NS00 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1GALT1Q9NS00 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1GALT1Q9NS00 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1GALT1Q9NS00 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1GALT1Q9NS00 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1GALT1Q9NS00 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1GALT1Q9NS00 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1GALT1Q9NS00 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1GALT1Q9NS00 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1GALT1Q9NS00 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1GALT1Q9NS00 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1GALT1Q9NS00 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1GALT1Q9NS00 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C1GALT1Q9NS00 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1GALT1Q9NS00 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1GALT1Q9NS00 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1GALT1Q9NS00 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1GALT1Q9NS00 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1GALT1Q9NS00 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1GALT1Q9NS00 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1GALT1Q9NS00 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1GALT1Q9NS00 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1GALT1Q9NS00 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1GALT1Q9NS00 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1GALT1Q9NS00 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
C1GALT1Q9NS00 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1GALT1Q9NS00 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms