Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.123e-8■■■□□ 17.7
APOBEC3CQ9NRW3 PDCD6-209ENST00000512466 3763 ntTSL 210.07□□□□□ -0.83e-8■■■□□ 17.7
APOBEC3CQ9NRW3 PDCD6-210ENST00000513582 3500 ntTSL 210.06□□□□□ -0.83e-8■■■□□ 17.7
APOBEC3CQ9NRW3 PDCD6-208ENST00000511482 878 ntTSL 59.84□□□□□ -0.833e-8■■■□□ 17.7
APOBEC3CQ9NRW3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.881e-7■■■□□ 17.6
APOBEC3CQ9NRW3 CNBP-206ENST00000502372 1026 ntTSL 511.44□□□□□ -0.586e-16■■■□□ 17.6
APOBEC3CQ9NRW3 RPS17-204ENST00000559776 760 ntTSL 215.66■□□□□ 0.13e-25■■■□□ 17.5
APOBEC3CQ9NRW3 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.71□□□□□ -1.983e-6■■■□□ 17.5
APOBEC3CQ9NRW3 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.644e-8■■■□□ 17.4
APOBEC3CQ9NRW3 ANP32E-208ENST00000583931 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.994e-8■■■□□ 17.4
APOBEC3CQ9NRW3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.559e-7■■■□□ 17.4
APOBEC3CQ9NRW3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.369e-7■■■□□ 17.4
APOBEC3CQ9NRW3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.369e-7■■■□□ 17.4
APOBEC3CQ9NRW3 POLR2F-212ENST00000492213 550 ntTSL 423.09■■□□□ 1.299e-7■■■□□ 17.4
APOBEC3CQ9NRW3 POLR2F-206ENST00000443002 1890 ntTSL 221.83■■□□□ 1.099e-7■■■□□ 17.4
APOBEC3CQ9NRW3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.99e-7■■■□□ 17.4
APOBEC3CQ9NRW3 POLR2F-209ENST00000483713 615 ntTSL 316.89■□□□□ 0.299e-7■■■□□ 17.4
APOBEC3CQ9NRW3 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.249e-7■■■□□ 17.4
APOBEC3CQ9NRW3 POLR2F-210ENST00000484894 551 ntTSL 415.05■□□□□ -09e-7■■■□□ 17.4
APOBEC3CQ9NRW3 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.149e-7■■■□□ 17.4
APOBEC3CQ9NRW3 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.149e-7■■■□□ 17.4
APOBEC3CQ9NRW3 UBE2E1-207ENST00000475680 1138 ntTSL 523.4■■□□□ 1.345e-9■■■□□ 17.3
APOBEC3CQ9NRW3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.135e-9■■■□□ 17.3
APOBEC3CQ9NRW3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.815e-9■■■□□ 17.3
APOBEC3CQ9NRW3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.725e-9■■■□□ 17.3
APOBEC3CQ9NRW3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.425e-9■■■□□ 17.3
APOBEC3CQ9NRW3 CERS5-226ENST00000551697 2260 ntTSL 516.15■□□□□ 0.185e-9■■■□□ 17.3
APOBEC3CQ9NRW3 CERS5-211ENST00000547787 2132 ntTSL 215.85■□□□□ 0.135e-9■■■□□ 17.3
APOBEC3CQ9NRW3 CERS5-206ENST00000546406 1041 ntTSL 214.73□□□□□ -0.055e-9■■■□□ 17.3
APOBEC3CQ9NRW3 CERS5-228ENST00000553122 1218 ntTSL 313.95□□□□□ -0.185e-9■■■□□ 17.3
APOBEC3CQ9NRW3 CERS5-223ENST00000550919 1077 ntTSL 313.95□□□□□ -0.185e-9■■■□□ 17.3
APOBEC3CQ9NRW3 NCAPG2-210ENST00000491792 581 ntTSL 313.39□□□□□ -0.275e-9■■■□□ 17.3
APOBEC3CQ9NRW3 CERS5-202ENST00000380189 2998 ntTSL 1 (best)12.68□□□□□ -0.385e-9■■■□□ 17.3
APOBEC3CQ9NRW3 NCAPG2-207ENST00000472591 554 ntTSL 411.63□□□□□ -0.555e-9■■■□□ 17.3
APOBEC3CQ9NRW3 UBE2E1-203ENST00000424381 1224 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.825e-9■■■□□ 17.3
APOBEC3CQ9NRW3 CERS5-224ENST00000551005 2700 ntTSL 29.64□□□□□ -0.875e-9■■■□□ 17.3
APOBEC3CQ9NRW3 NCAPG2-206ENST00000467785 3276 ntTSL 1 (best)8.08□□□□□ -1.125e-9■■■□□ 17.3
APOBEC3CQ9NRW3 UBE2E1-205ENST00000452012 1166 ntTSL 36.75□□□□□ -1.335e-9■■■□□ 17.3
APOBEC3CQ9NRW3 UBE2E1-210ENST00000493707 857 ntTSL 36.59□□□□□ -1.355e-9■■■□□ 17.3
APOBEC3CQ9NRW3 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.395e-9■■■□□ 17.3
APOBEC3CQ9NRW3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.075e-8■■■□□ 17.3
APOBEC3CQ9NRW3 RANBP1-211ENST00000448394 688 ntTSL 215.73■□□□□ 0.115e-8■■■□□ 17.3
APOBEC3CQ9NRW3 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.095e-8■■■□□ 17.3
APOBEC3CQ9NRW3 TSNAX-DISC1-203ENST00000602885 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 213.18□□□□□ -0.33e-6■■■□□ 17.1
APOBEC3CQ9NRW3 TSNAX-DISC1-202ENST00000602634 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 210.43□□□□□ -0.743e-6■■■□□ 17.1
APOBEC3CQ9NRW3 TSNAX-DISC1-204ENST00000602956 3294 ntAPPRIS P5 TSL 210.29□□□□□ -0.763e-6■■■□□ 17.1
APOBEC3CQ9NRW3 TSNAX-DISC1-201ENST00000602567 3454 ntAPPRIS ALT2 TSL 210.28□□□□□ -0.763e-6■■■□□ 17.1
APOBEC3CQ9NRW3 TSNAX-DISC1-205ENST00000602962 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.833e-6■■■□□ 17.1
APOBEC3CQ9NRW3 TSNAX-201ENST00000366639 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.973e-6■■■□□ 17.1
APOBEC3CQ9NRW3 TSNAX-203ENST00000475168 5629 ntTSL 27.7□□□□□ -1.183e-6■■■□□ 17.1
APOBEC3CQ9NRW3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.021e-6■■■□□ 17.1
APOBEC3CQ9NRW3 NASP-202ENST00000351223 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.665e-8■■■□□ 17.1
APOBEC3CQ9NRW3 NASP-209ENST00000472408 541 ntTSL 210.92□□□□□ -0.665e-8■■■□□ 17.1
APOBEC3CQ9NRW3 NASP-221ENST00000531612 938 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.7□□□□□ -1.025e-8■■■□□ 17.1
APOBEC3CQ9NRW3 NASP-201ENST00000350030 3207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.065e-8■■■□□ 17.1
APOBEC3CQ9NRW3 NASP-224ENST00000537798 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.135e-8■■■□□ 17.1
APOBEC3CQ9NRW3 NASP-203ENST00000372052 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.145e-8■■■□□ 17.1
APOBEC3CQ9NRW3 NASP-218ENST00000530073 2740 ntTSL 27.84□□□□□ -1.155e-8■■■□□ 17.1
APOBEC3CQ9NRW3 NASP-223ENST00000534450 632 ntTSL 27.67□□□□□ -1.185e-8■■■□□ 17.1
APOBEC3CQ9NRW3 NASP-210ENST00000481782 3659 ntTSL 26.46□□□□□ -1.385e-8■■■□□ 17.1
APOBEC3CQ9NRW3 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.38□□□□□ -1.715e-27■■■□□ 17.1
APOBEC3CQ9NRW3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.056e-8■■■□□ 17
APOBEC3CQ9NRW3 RAC3-204ENST00000585014 798 ntTSL 220.19■□□□□ 0.826e-8■■■□□ 17
APOBEC3CQ9NRW3 UQCC2-202ENST00000374231 509 ntTSL 315.94■□□□□ 0.142e-7■■■□□ 17
APOBEC3CQ9NRW3 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -02e-7■■■□□ 17
APOBEC3CQ9NRW3 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.042e-7■■■□□ 17
APOBEC3CQ9NRW3 UQCC2-203ENST00000606961 4365 nt11.81□□□□□ -0.522e-7■■■□□ 17
APOBEC3CQ9NRW3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.61e-9■■■□□ 17
APOBEC3CQ9NRW3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.391e-9■■■□□ 17
APOBEC3CQ9NRW3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.362e-7■■■□□ 17
APOBEC3CQ9NRW3 FKBP8-203ENST00000594844 593 ntTSL 423.31■■□□□ 1.321e-9■■■□□ 17
APOBEC3CQ9NRW3 AP1S1-203ENST00000443943 741 ntTSL 322.99■■□□□ 1.272e-7■■■□□ 17
APOBEC3CQ9NRW3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.811e-9■■■□□ 17
APOBEC3CQ9NRW3 NOC2L-204ENST00000483767 1611 ntTSL 219.8■□□□□ 0.762e-7■■■□□ 17
APOBEC3CQ9NRW3 FKBP8-202ENST00000544835 1292 ntTSL 1 (best)19.77■□□□□ 0.761e-9■■■□□ 17
APOBEC3CQ9NRW3 TUFM-203ENST00000565012 966 ntTSL 518.87■□□□□ 0.612e-7■■■□□ 17
APOBEC3CQ9NRW3 FKBP8-211ENST00000601844 1548 ntTSL 518.54■□□□□ 0.561e-9■■■□□ 17
APOBEC3CQ9NRW3 FKBP8-207ENST00000597547 574 ntTSL 318.35■□□□□ 0.531e-9■■■□□ 17
APOBEC3CQ9NRW3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.331e-9■■■□□ 17
APOBEC3CQ9NRW3 FKBP8-208ENST00000597611 966 ntTSL 316.8■□□□□ 0.281e-9■■■□□ 17
APOBEC3CQ9NRW3 FKBP8-210ENST00000599540 1140 ntTSL 214.49□□□□□ -0.091e-9■■■□□ 17
APOBEC3CQ9NRW3 CTNNB1-212ENST00000471014 607 ntTSL 314.2□□□□□ -0.143e-6■■■□□ 17
APOBEC3CQ9NRW3 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.182e-7■■■□□ 17
APOBEC3CQ9NRW3 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.223e-6■■■□□ 17
APOBEC3CQ9NRW3 NOC2L-203ENST00000477976 4201 ntTSL 511.37□□□□□ -0.592e-7■■■□□ 17
APOBEC3CQ9NRW3 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.593e-6■■■□□ 17
APOBEC3CQ9NRW3 CTNNB1-203ENST00000396185 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.63e-6■■■□□ 17
APOBEC3CQ9NRW3 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.14□□□□□ -2.072e-7■■■□□ 17
APOBEC3CQ9NRW3 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.33e-15■■■□□ 16.9
APOBEC3CQ9NRW3 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.033e-15■■■□□ 16.9
APOBEC3CQ9NRW3 EIF3K-210ENST00000591409 583 ntTSL 314.38□□□□□ -0.113e-15■■■□□ 16.9
APOBEC3CQ9NRW3 EIF3K-213ENST00000593149 760 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.293e-15■■■□□ 16.9
APOBEC3CQ9NRW3 EIF3K-214ENST00000614624 780 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.513e-15■■■□□ 16.9
APOBEC3CQ9NRW3 EIF3K-208ENST00000588934 501 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.633e-15■■■□□ 16.9
APOBEC3CQ9NRW3 EIF3K-201ENST00000248342 864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.663e-15■■■□□ 16.9
APOBEC3CQ9NRW3 EIF3K-211ENST00000592558 670 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.723e-15■■■□□ 16.9
APOBEC3CQ9NRW3 EIF3K-209ENST00000590134 711 ntTSL 29.78□□□□□ -0.843e-15■■■□□ 16.9
APOBEC3CQ9NRW3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.646e-8■■■□□ 16.9
APOBEC3CQ9NRW3 HOXB7-203ENST00000567101 528 ntTSL 211.48□□□□□ -0.576e-8■■■□□ 16.9
APOBEC3CQ9NRW3 BCAT1-205ENST00000539282 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.559e-9■■■□□ 16.8
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