Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB6BQ9NRW1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB6BQ9NRW1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB6BQ9NRW1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB6BQ9NRW1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB6BQ9NRW1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB6BQ9NRW1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB6BQ9NRW1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB6BQ9NRW1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB6BQ9NRW1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB6BQ9NRW1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB6BQ9NRW1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB6BQ9NRW1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB6BQ9NRW1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB6BQ9NRW1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB6BQ9NRW1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB6BQ9NRW1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB6BQ9NRW1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB6BQ9NRW1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB6BQ9NRW1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB6BQ9NRW1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB6BQ9NRW1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB6BQ9NRW1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB6BQ9NRW1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB6BQ9NRW1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB6BQ9NRW1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB6BQ9NRW1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB6BQ9NRW1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB6BQ9NRW1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB6BQ9NRW1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB6BQ9NRW1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB6BQ9NRW1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB6BQ9NRW1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB6BQ9NRW1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB6BQ9NRW1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB6BQ9NRW1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB6BQ9NRW1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB6BQ9NRW1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB6BQ9NRW1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAB6BQ9NRW1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB6BQ9NRW1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB6BQ9NRW1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB6BQ9NRW1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB6BQ9NRW1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB6BQ9NRW1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB6BQ9NRW1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB6BQ9NRW1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB6BQ9NRW1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB6BQ9NRW1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB6BQ9NRW1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB6BQ9NRW1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB6BQ9NRW1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB6BQ9NRW1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB6BQ9NRW1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB6BQ9NRW1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB6BQ9NRW1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB6BQ9NRW1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB6BQ9NRW1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB6BQ9NRW1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB6BQ9NRW1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB6BQ9NRW1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RAB6BQ9NRW1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RAB6BQ9NRW1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB6BQ9NRW1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB6BQ9NRW1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB6BQ9NRW1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB6BQ9NRW1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB6BQ9NRW1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB6BQ9NRW1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB6BQ9NRW1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB6BQ9NRW1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB6BQ9NRW1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB6BQ9NRW1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB6BQ9NRW1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB6BQ9NRW1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB6BQ9NRW1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB6BQ9NRW1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB6BQ9NRW1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB6BQ9NRW1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB6BQ9NRW1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB6BQ9NRW1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB6BQ9NRW1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB6BQ9NRW1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB6BQ9NRW1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB6BQ9NRW1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB6BQ9NRW1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB6BQ9NRW1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB6BQ9NRW1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB6BQ9NRW1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB6BQ9NRW1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB6BQ9NRW1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB6BQ9NRW1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB6BQ9NRW1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB6BQ9NRW1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB6BQ9NRW1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB6BQ9NRW1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB6BQ9NRW1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB6BQ9NRW1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB6BQ9NRW1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB6BQ9NRW1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms