Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBQLN4Q9NRR5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBQLN4Q9NRR5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBQLN4Q9NRR5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBQLN4Q9NRR5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBQLN4Q9NRR5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBQLN4Q9NRR5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBQLN4Q9NRR5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBQLN4Q9NRR5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBQLN4Q9NRR5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBQLN4Q9NRR5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBQLN4Q9NRR5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBQLN4Q9NRR5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBQLN4Q9NRR5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBQLN4Q9NRR5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBQLN4Q9NRR5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBQLN4Q9NRR5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBQLN4Q9NRR5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBQLN4Q9NRR5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBQLN4Q9NRR5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBQLN4Q9NRR5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBQLN4Q9NRR5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBQLN4Q9NRR5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBQLN4Q9NRR5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UBQLN4Q9NRR5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBQLN4Q9NRR5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBQLN4Q9NRR5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBQLN4Q9NRR5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBQLN4Q9NRR5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBQLN4Q9NRR5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBQLN4Q9NRR5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBQLN4Q9NRR5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBQLN4Q9NRR5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBQLN4Q9NRR5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBQLN4Q9NRR5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBQLN4Q9NRR5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
UBQLN4Q9NRR5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBQLN4Q9NRR5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBQLN4Q9NRR5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBQLN4Q9NRR5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBQLN4Q9NRR5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBQLN4Q9NRR5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBQLN4Q9NRR5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBQLN4Q9NRR5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBQLN4Q9NRR5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBQLN4Q9NRR5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBQLN4Q9NRR5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBQLN4Q9NRR5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBQLN4Q9NRR5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBQLN4Q9NRR5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UBQLN4Q9NRR5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
UBQLN4Q9NRR5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBQLN4Q9NRR5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBQLN4Q9NRR5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBQLN4Q9NRR5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBQLN4Q9NRR5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBQLN4Q9NRR5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBQLN4Q9NRR5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBQLN4Q9NRR5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBQLN4Q9NRR5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBQLN4Q9NRR5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBQLN4Q9NRR5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBQLN4Q9NRR5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UBQLN4Q9NRR5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBQLN4Q9NRR5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms