Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHST12Q9NRB3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHST12Q9NRB3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHST12Q9NRB3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CHST12Q9NRB3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CHST12Q9NRB3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CHST12Q9NRB3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CHST12Q9NRB3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHST12Q9NRB3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHST12Q9NRB3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CHST12Q9NRB3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CHST12Q9NRB3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHST12Q9NRB3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CHST12Q9NRB3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CHST12Q9NRB3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CHST12Q9NRB3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHST12Q9NRB3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHST12Q9NRB3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHST12Q9NRB3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHST12Q9NRB3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHST12Q9NRB3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHST12Q9NRB3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CHST12Q9NRB3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHST12Q9NRB3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHST12Q9NRB3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHST12Q9NRB3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHST12Q9NRB3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHST12Q9NRB3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHST12Q9NRB3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHST12Q9NRB3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHST12Q9NRB3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHST12Q9NRB3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHST12Q9NRB3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHST12Q9NRB3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHST12Q9NRB3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHST12Q9NRB3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHST12Q9NRB3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHST12Q9NRB3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHST12Q9NRB3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CHST12Q9NRB3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHST12Q9NRB3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHST12Q9NRB3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHST12Q9NRB3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHST12Q9NRB3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHST12Q9NRB3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHST12Q9NRB3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHST12Q9NRB3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHST12Q9NRB3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHST12Q9NRB3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHST12Q9NRB3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHST12Q9NRB3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHST12Q9NRB3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHST12Q9NRB3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHST12Q9NRB3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CHST12Q9NRB3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHST12Q9NRB3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHST12Q9NRB3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CHST12Q9NRB3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHST12Q9NRB3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHST12Q9NRB3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHST12Q9NRB3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHST12Q9NRB3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CHST12Q9NRB3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CHST12Q9NRB3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHST12Q9NRB3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHST12Q9NRB3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHST12Q9NRB3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHST12Q9NRB3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHST12Q9NRB3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHST12Q9NRB3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHST12Q9NRB3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHST12Q9NRB3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHST12Q9NRB3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHST12Q9NRB3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHST12Q9NRB3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CHST12Q9NRB3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHST12Q9NRB3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHST12Q9NRB3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHST12Q9NRB3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHST12Q9NRB3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHST12Q9NRB3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHST12Q9NRB3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHST12Q9NRB3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHST12Q9NRB3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHST12Q9NRB3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHST12Q9NRB3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHST12Q9NRB3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHST12Q9NRB3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHST12Q9NRB3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHST12Q9NRB3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHST12Q9NRB3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHST12Q9NRB3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHST12Q9NRB3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHST12Q9NRB3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHST12Q9NRB3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHST12Q9NRB3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHST12Q9NRB3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHST12Q9NRB3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHST12Q9NRB3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHST12Q9NRB3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms