Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP84

TNFRSF12A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 12A, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF12AQ9NP84 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF12AQ9NP84 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF12AQ9NP84 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF12AQ9NP84 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF12AQ9NP84 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF12AQ9NP84 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF12AQ9NP84 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF12AQ9NP84 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF12AQ9NP84 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF12AQ9NP84 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TNFRSF12AQ9NP84 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNFRSF12AQ9NP84 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFRSF12AQ9NP84 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFRSF12AQ9NP84 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFRSF12AQ9NP84 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFRSF12AQ9NP84 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFRSF12AQ9NP84 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF12AQ9NP84 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF12AQ9NP84 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF12AQ9NP84 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF12AQ9NP84 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF12AQ9NP84 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF12AQ9NP84 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF12AQ9NP84 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF12AQ9NP84 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF12AQ9NP84 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF12AQ9NP84 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF12AQ9NP84 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF12AQ9NP84 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF12AQ9NP84 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF12AQ9NP84 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF12AQ9NP84 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF12AQ9NP84 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF12AQ9NP84 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF12AQ9NP84 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF12AQ9NP84 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF12AQ9NP84 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF12AQ9NP84 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF12AQ9NP84 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TNFRSF12AQ9NP84 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNFRSF12AQ9NP84 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFRSF12AQ9NP84 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFRSF12AQ9NP84 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF12AQ9NP84 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF12AQ9NP84 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF12AQ9NP84 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF12AQ9NP84 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF12AQ9NP84 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF12AQ9NP84 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF12AQ9NP84 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF12AQ9NP84 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF12AQ9NP84 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF12AQ9NP84 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF12AQ9NP84 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF12AQ9NP84 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF12AQ9NP84 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF12AQ9NP84 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF12AQ9NP84 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF12AQ9NP84 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF12AQ9NP84 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF12AQ9NP84 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFRSF12AQ9NP84 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFRSF12AQ9NP84 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFRSF12AQ9NP84 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFRSF12AQ9NP84 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFRSF12AQ9NP84 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFRSF12AQ9NP84 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFRSF12AQ9NP84 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFRSF12AQ9NP84 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFRSF12AQ9NP84 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFRSF12AQ9NP84 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFRSF12AQ9NP84 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF12AQ9NP84 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF12AQ9NP84 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF12AQ9NP84 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF12AQ9NP84 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF12AQ9NP84 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF12AQ9NP84 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF12AQ9NP84 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF12AQ9NP84 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF12AQ9NP84 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF12AQ9NP84 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF12AQ9NP84 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF12AQ9NP84 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF12AQ9NP84 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF12AQ9NP84 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF12AQ9NP84 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF12AQ9NP84 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF12AQ9NP84 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF12AQ9NP84 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF12AQ9NP84 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF12AQ9NP84 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF12AQ9NP84 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF12AQ9NP84 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF12AQ9NP84 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF12AQ9NP84 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF12AQ9NP84 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF12AQ9NP84 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF12AQ9NP84 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF12AQ9NP84 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms