Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP78

ABCB9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB9Q9NP78 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCB9Q9NP78 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCB9Q9NP78 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB9Q9NP78 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB9Q9NP78 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB9Q9NP78 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB9Q9NP78 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB9Q9NP78 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB9Q9NP78 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB9Q9NP78 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB9Q9NP78 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB9Q9NP78 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB9Q9NP78 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB9Q9NP78 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB9Q9NP78 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB9Q9NP78 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB9Q9NP78 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB9Q9NP78 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB9Q9NP78 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB9Q9NP78 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB9Q9NP78 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB9Q9NP78 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB9Q9NP78 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB9Q9NP78 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB9Q9NP78 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB9Q9NP78 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB9Q9NP78 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB9Q9NP78 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB9Q9NP78 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB9Q9NP78 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB9Q9NP78 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCB9Q9NP78 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB9Q9NP78 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB9Q9NP78 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB9Q9NP78 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB9Q9NP78 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB9Q9NP78 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB9Q9NP78 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB9Q9NP78 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB9Q9NP78 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB9Q9NP78 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB9Q9NP78 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB9Q9NP78 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB9Q9NP78 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB9Q9NP78 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB9Q9NP78 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB9Q9NP78 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB9Q9NP78 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB9Q9NP78 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB9Q9NP78 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB9Q9NP78 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB9Q9NP78 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB9Q9NP78 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB9Q9NP78 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB9Q9NP78 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB9Q9NP78 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB9Q9NP78 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB9Q9NP78 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB9Q9NP78 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB9Q9NP78 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB9Q9NP78 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB9Q9NP78 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ABCB9Q9NP78 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB9Q9NP78 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB9Q9NP78 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB9Q9NP78 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms