Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMG20AQ9NP66 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMG20AQ9NP66 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMG20AQ9NP66 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMG20AQ9NP66 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMG20AQ9NP66 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMG20AQ9NP66 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMG20AQ9NP66 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMG20AQ9NP66 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMG20AQ9NP66 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMG20AQ9NP66 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMG20AQ9NP66 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMG20AQ9NP66 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMG20AQ9NP66 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMG20AQ9NP66 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMG20AQ9NP66 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMG20AQ9NP66 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMG20AQ9NP66 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMG20AQ9NP66 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMG20AQ9NP66 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HMG20AQ9NP66 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMG20AQ9NP66 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMG20AQ9NP66 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMG20AQ9NP66 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMG20AQ9NP66 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMG20AQ9NP66 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMG20AQ9NP66 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMG20AQ9NP66 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMG20AQ9NP66 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMG20AQ9NP66 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMG20AQ9NP66 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMG20AQ9NP66 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMG20AQ9NP66 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMG20AQ9NP66 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMG20AQ9NP66 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMG20AQ9NP66 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMG20AQ9NP66 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMG20AQ9NP66 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMG20AQ9NP66 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMG20AQ9NP66 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMG20AQ9NP66 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMG20AQ9NP66 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMG20AQ9NP66 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMG20AQ9NP66 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMG20AQ9NP66 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMG20AQ9NP66 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMG20AQ9NP66 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HMG20AQ9NP66 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMG20AQ9NP66 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMG20AQ9NP66 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMG20AQ9NP66 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMG20AQ9NP66 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMG20AQ9NP66 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMG20AQ9NP66 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMG20AQ9NP66 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMG20AQ9NP66 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMG20AQ9NP66 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMG20AQ9NP66 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMG20AQ9NP66 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMG20AQ9NP66 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMG20AQ9NP66 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMG20AQ9NP66 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMG20AQ9NP66 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMG20AQ9NP66 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMG20AQ9NP66 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMG20AQ9NP66 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMG20AQ9NP66 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMG20AQ9NP66 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMG20AQ9NP66 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMG20AQ9NP66 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMG20AQ9NP66 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMG20AQ9NP66 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMG20AQ9NP66 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMG20AQ9NP66 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMG20AQ9NP66 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMG20AQ9NP66 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMG20AQ9NP66 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMG20AQ9NP66 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMG20AQ9NP66 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMG20AQ9NP66 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms