Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCI7

MSL2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL2Q9HCI7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSL2Q9HCI7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSL2Q9HCI7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSL2Q9HCI7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSL2Q9HCI7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSL2Q9HCI7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSL2Q9HCI7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSL2Q9HCI7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSL2Q9HCI7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSL2Q9HCI7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSL2Q9HCI7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSL2Q9HCI7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSL2Q9HCI7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSL2Q9HCI7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSL2Q9HCI7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSL2Q9HCI7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSL2Q9HCI7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSL2Q9HCI7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSL2Q9HCI7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MSL2Q9HCI7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSL2Q9HCI7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSL2Q9HCI7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSL2Q9HCI7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSL2Q9HCI7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MSL2Q9HCI7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MSL2Q9HCI7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSL2Q9HCI7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSL2Q9HCI7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSL2Q9HCI7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSL2Q9HCI7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSL2Q9HCI7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSL2Q9HCI7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSL2Q9HCI7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSL2Q9HCI7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSL2Q9HCI7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSL2Q9HCI7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSL2Q9HCI7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSL2Q9HCI7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSL2Q9HCI7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSL2Q9HCI7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSL2Q9HCI7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MSL2Q9HCI7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MSL2Q9HCI7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSL2Q9HCI7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSL2Q9HCI7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSL2Q9HCI7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSL2Q9HCI7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSL2Q9HCI7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSL2Q9HCI7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSL2Q9HCI7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL2Q9HCI7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL2Q9HCI7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL2Q9HCI7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL2Q9HCI7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL2Q9HCI7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSL2Q9HCI7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSL2Q9HCI7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSL2Q9HCI7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MSL2Q9HCI7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms