Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAV7

GRPEL1, GrpE protein homolog 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRPEL1Q9HAV7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRPEL1Q9HAV7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRPEL1Q9HAV7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRPEL1Q9HAV7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRPEL1Q9HAV7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRPEL1Q9HAV7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRPEL1Q9HAV7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GRPEL1Q9HAV7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GRPEL1Q9HAV7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GRPEL1Q9HAV7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRPEL1Q9HAV7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRPEL1Q9HAV7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GRPEL1Q9HAV7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRPEL1Q9HAV7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRPEL1Q9HAV7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRPEL1Q9HAV7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRPEL1Q9HAV7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRPEL1Q9HAV7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRPEL1Q9HAV7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GRPEL1Q9HAV7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRPEL1Q9HAV7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRPEL1Q9HAV7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRPEL1Q9HAV7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRPEL1Q9HAV7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRPEL1Q9HAV7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRPEL1Q9HAV7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRPEL1Q9HAV7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRPEL1Q9HAV7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRPEL1Q9HAV7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRPEL1Q9HAV7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRPEL1Q9HAV7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRPEL1Q9HAV7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRPEL1Q9HAV7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GRPEL1Q9HAV7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GRPEL1Q9HAV7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRPEL1Q9HAV7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRPEL1Q9HAV7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRPEL1Q9HAV7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRPEL1Q9HAV7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRPEL1Q9HAV7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRPEL1Q9HAV7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRPEL1Q9HAV7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRPEL1Q9HAV7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRPEL1Q9HAV7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRPEL1Q9HAV7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRPEL1Q9HAV7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRPEL1Q9HAV7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRPEL1Q9HAV7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRPEL1Q9HAV7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
GRPEL1Q9HAV7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRPEL1Q9HAV7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRPEL1Q9HAV7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRPEL1Q9HAV7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRPEL1Q9HAV7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRPEL1Q9HAV7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRPEL1Q9HAV7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRPEL1Q9HAV7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRPEL1Q9HAV7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRPEL1Q9HAV7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRPEL1Q9HAV7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRPEL1Q9HAV7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRPEL1Q9HAV7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRPEL1Q9HAV7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GRPEL1Q9HAV7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRPEL1Q9HAV7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GRPEL1Q9HAV7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRPEL1Q9HAV7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRPEL1Q9HAV7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRPEL1Q9HAV7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRPEL1Q9HAV7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRPEL1Q9HAV7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRPEL1Q9HAV7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRPEL1Q9HAV7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRPEL1Q9HAV7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
GRPEL1Q9HAV7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRPEL1Q9HAV7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
GRPEL1Q9HAV7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRPEL1Q9HAV7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GRPEL1Q9HAV7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRPEL1Q9HAV7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRPEL1Q9HAV7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRPEL1Q9HAV7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRPEL1Q9HAV7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRPEL1Q9HAV7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRPEL1Q9HAV7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRPEL1Q9HAV7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRPEL1Q9HAV7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRPEL1Q9HAV7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRPEL1Q9HAV7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRPEL1Q9HAV7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRPEL1Q9HAV7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRPEL1Q9HAV7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRPEL1Q9HAV7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRPEL1Q9HAV7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRPEL1Q9HAV7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GRPEL1Q9HAV7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRPEL1Q9HAV7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRPEL1Q9HAV7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRPEL1Q9HAV7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRPEL1Q9HAV7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.8 ms