Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q4

NHEJ1, Non-homologous end-joining factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHEJ1Q9H9Q4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NHEJ1Q9H9Q4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NHEJ1Q9H9Q4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NHEJ1Q9H9Q4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NHEJ1Q9H9Q4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NHEJ1Q9H9Q4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NHEJ1Q9H9Q4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NHEJ1Q9H9Q4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NHEJ1Q9H9Q4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NHEJ1Q9H9Q4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NHEJ1Q9H9Q4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NHEJ1Q9H9Q4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NHEJ1Q9H9Q4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NHEJ1Q9H9Q4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NHEJ1Q9H9Q4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NHEJ1Q9H9Q4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NHEJ1Q9H9Q4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NHEJ1Q9H9Q4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NHEJ1Q9H9Q4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NHEJ1Q9H9Q4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NHEJ1Q9H9Q4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NHEJ1Q9H9Q4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
NHEJ1Q9H9Q4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NHEJ1Q9H9Q4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NHEJ1Q9H9Q4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NHEJ1Q9H9Q4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NHEJ1Q9H9Q4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NHEJ1Q9H9Q4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NHEJ1Q9H9Q4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NHEJ1Q9H9Q4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NHEJ1Q9H9Q4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NHEJ1Q9H9Q4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NHEJ1Q9H9Q4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NHEJ1Q9H9Q4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NHEJ1Q9H9Q4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NHEJ1Q9H9Q4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NHEJ1Q9H9Q4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NHEJ1Q9H9Q4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NHEJ1Q9H9Q4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NHEJ1Q9H9Q4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NHEJ1Q9H9Q4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NHEJ1Q9H9Q4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NHEJ1Q9H9Q4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NHEJ1Q9H9Q4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NHEJ1Q9H9Q4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NHEJ1Q9H9Q4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NHEJ1Q9H9Q4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NHEJ1Q9H9Q4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NHEJ1Q9H9Q4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NHEJ1Q9H9Q4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NHEJ1Q9H9Q4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NHEJ1Q9H9Q4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NHEJ1Q9H9Q4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NHEJ1Q9H9Q4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NHEJ1Q9H9Q4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NHEJ1Q9H9Q4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NHEJ1Q9H9Q4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NHEJ1Q9H9Q4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NHEJ1Q9H9Q4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NHEJ1Q9H9Q4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NHEJ1Q9H9Q4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NHEJ1Q9H9Q4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NHEJ1Q9H9Q4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NHEJ1Q9H9Q4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NHEJ1Q9H9Q4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NHEJ1Q9H9Q4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NHEJ1Q9H9Q4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NHEJ1Q9H9Q4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NHEJ1Q9H9Q4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NHEJ1Q9H9Q4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NHEJ1Q9H9Q4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NHEJ1Q9H9Q4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NHEJ1Q9H9Q4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NHEJ1Q9H9Q4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NHEJ1Q9H9Q4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NHEJ1Q9H9Q4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NHEJ1Q9H9Q4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NHEJ1Q9H9Q4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NHEJ1Q9H9Q4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NHEJ1Q9H9Q4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NHEJ1Q9H9Q4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NHEJ1Q9H9Q4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NHEJ1Q9H9Q4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NHEJ1Q9H9Q4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NHEJ1Q9H9Q4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NHEJ1Q9H9Q4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NHEJ1Q9H9Q4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NHEJ1Q9H9Q4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NHEJ1Q9H9Q4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NHEJ1Q9H9Q4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NHEJ1Q9H9Q4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NHEJ1Q9H9Q4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NHEJ1Q9H9Q4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NHEJ1Q9H9Q4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NHEJ1Q9H9Q4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NHEJ1Q9H9Q4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NHEJ1Q9H9Q4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NHEJ1Q9H9Q4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms