Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E1

ANKRA2, Ankyrin repeat family A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRA2Q9H9E1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRA2Q9H9E1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRA2Q9H9E1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRA2Q9H9E1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRA2Q9H9E1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRA2Q9H9E1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRA2Q9H9E1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRA2Q9H9E1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRA2Q9H9E1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRA2Q9H9E1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRA2Q9H9E1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRA2Q9H9E1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRA2Q9H9E1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRA2Q9H9E1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRA2Q9H9E1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRA2Q9H9E1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRA2Q9H9E1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRA2Q9H9E1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRA2Q9H9E1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRA2Q9H9E1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRA2Q9H9E1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRA2Q9H9E1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRA2Q9H9E1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRA2Q9H9E1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRA2Q9H9E1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRA2Q9H9E1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRA2Q9H9E1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRA2Q9H9E1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRA2Q9H9E1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRA2Q9H9E1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRA2Q9H9E1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRA2Q9H9E1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRA2Q9H9E1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRA2Q9H9E1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRA2Q9H9E1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRA2Q9H9E1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRA2Q9H9E1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRA2Q9H9E1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRA2Q9H9E1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRA2Q9H9E1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRA2Q9H9E1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRA2Q9H9E1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRA2Q9H9E1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRA2Q9H9E1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRA2Q9H9E1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRA2Q9H9E1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRA2Q9H9E1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRA2Q9H9E1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRA2Q9H9E1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRA2Q9H9E1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRA2Q9H9E1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRA2Q9H9E1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRA2Q9H9E1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRA2Q9H9E1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRA2Q9H9E1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRA2Q9H9E1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRA2Q9H9E1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRA2Q9H9E1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRA2Q9H9E1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRA2Q9H9E1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRA2Q9H9E1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRA2Q9H9E1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRA2Q9H9E1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ANKRA2Q9H9E1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms