Protein–RNA interactions for Protein: Q9H987

SYNPO2L, Synaptopodin 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2LQ9H987 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNPO2LQ9H987 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNPO2LQ9H987 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNPO2LQ9H987 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNPO2LQ9H987 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNPO2LQ9H987 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNPO2LQ9H987 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNPO2LQ9H987 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNPO2LQ9H987 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNPO2LQ9H987 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNPO2LQ9H987 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNPO2LQ9H987 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNPO2LQ9H987 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNPO2LQ9H987 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNPO2LQ9H987 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNPO2LQ9H987 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNPO2LQ9H987 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNPO2LQ9H987 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNPO2LQ9H987 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNPO2LQ9H987 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNPO2LQ9H987 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNPO2LQ9H987 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNPO2LQ9H987 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNPO2LQ9H987 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNPO2LQ9H987 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNPO2LQ9H987 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNPO2LQ9H987 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNPO2LQ9H987 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNPO2LQ9H987 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNPO2LQ9H987 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNPO2LQ9H987 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNPO2LQ9H987 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNPO2LQ9H987 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNPO2LQ9H987 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNPO2LQ9H987 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNPO2LQ9H987 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNPO2LQ9H987 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNPO2LQ9H987 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNPO2LQ9H987 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNPO2LQ9H987 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNPO2LQ9H987 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNPO2LQ9H987 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNPO2LQ9H987 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNPO2LQ9H987 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNPO2LQ9H987 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNPO2LQ9H987 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNPO2LQ9H987 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNPO2LQ9H987 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNPO2LQ9H987 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNPO2LQ9H987 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNPO2LQ9H987 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNPO2LQ9H987 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNPO2LQ9H987 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNPO2LQ9H987 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNPO2LQ9H987 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNPO2LQ9H987 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNPO2LQ9H987 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNPO2LQ9H987 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNPO2LQ9H987 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNPO2LQ9H987 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNPO2LQ9H987 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNPO2LQ9H987 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNPO2LQ9H987 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNPO2LQ9H987 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNPO2LQ9H987 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNPO2LQ9H987 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNPO2LQ9H987 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNPO2LQ9H987 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNPO2LQ9H987 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNPO2LQ9H987 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNPO2LQ9H987 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNPO2LQ9H987 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms