Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NRDE2Q9H7Z3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NRDE2Q9H7Z3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NRDE2Q9H7Z3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NRDE2Q9H7Z3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NRDE2Q9H7Z3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NRDE2Q9H7Z3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRDE2Q9H7Z3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRDE2Q9H7Z3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRDE2Q9H7Z3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRDE2Q9H7Z3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NRDE2Q9H7Z3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NRDE2Q9H7Z3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRDE2Q9H7Z3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRDE2Q9H7Z3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRDE2Q9H7Z3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRDE2Q9H7Z3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRDE2Q9H7Z3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRDE2Q9H7Z3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRDE2Q9H7Z3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NRDE2Q9H7Z3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NRDE2Q9H7Z3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NRDE2Q9H7Z3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NRDE2Q9H7Z3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NRDE2Q9H7Z3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NRDE2Q9H7Z3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NRDE2Q9H7Z3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRDE2Q9H7Z3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NRDE2Q9H7Z3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRDE2Q9H7Z3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRDE2Q9H7Z3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRDE2Q9H7Z3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRDE2Q9H7Z3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NRDE2Q9H7Z3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRDE2Q9H7Z3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NRDE2Q9H7Z3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRDE2Q9H7Z3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRDE2Q9H7Z3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRDE2Q9H7Z3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRDE2Q9H7Z3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NRDE2Q9H7Z3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRDE2Q9H7Z3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRDE2Q9H7Z3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRDE2Q9H7Z3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRDE2Q9H7Z3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRDE2Q9H7Z3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRDE2Q9H7Z3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRDE2Q9H7Z3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRDE2Q9H7Z3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRDE2Q9H7Z3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRDE2Q9H7Z3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRDE2Q9H7Z3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NRDE2Q9H7Z3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NRDE2Q9H7Z3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NRDE2Q9H7Z3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NRDE2Q9H7Z3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NRDE2Q9H7Z3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NRDE2Q9H7Z3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NRDE2Q9H7Z3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NRDE2Q9H7Z3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NRDE2Q9H7Z3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NRDE2Q9H7Z3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NRDE2Q9H7Z3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRDE2Q9H7Z3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRDE2Q9H7Z3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NRDE2Q9H7Z3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRDE2Q9H7Z3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRDE2Q9H7Z3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRDE2Q9H7Z3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRDE2Q9H7Z3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRDE2Q9H7Z3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRDE2Q9H7Z3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRDE2Q9H7Z3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRDE2Q9H7Z3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRDE2Q9H7Z3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NRDE2Q9H7Z3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRDE2Q9H7Z3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NRDE2Q9H7Z3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRDE2Q9H7Z3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRDE2Q9H7Z3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRDE2Q9H7Z3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRDE2Q9H7Z3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRDE2Q9H7Z3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRDE2Q9H7Z3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRDE2Q9H7Z3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NRDE2Q9H7Z3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRDE2Q9H7Z3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRDE2Q9H7Z3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRDE2Q9H7Z3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRDE2Q9H7Z3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRDE2Q9H7Z3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRDE2Q9H7Z3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NRDE2Q9H7Z3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRDE2Q9H7Z3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NRDE2Q9H7Z3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NRDE2Q9H7Z3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NRDE2Q9H7Z3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NRDE2Q9H7Z3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms