Protein–RNA interactions for Protein: Q9H790

EXO5, Exonuclease V, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXO5Q9H790 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EXO5Q9H790 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EXO5Q9H790 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EXO5Q9H790 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXO5Q9H790 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXO5Q9H790 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EXO5Q9H790 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXO5Q9H790 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXO5Q9H790 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXO5Q9H790 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXO5Q9H790 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXO5Q9H790 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXO5Q9H790 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXO5Q9H790 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXO5Q9H790 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXO5Q9H790 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXO5Q9H790 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXO5Q9H790 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXO5Q9H790 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXO5Q9H790 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXO5Q9H790 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXO5Q9H790 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXO5Q9H790 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXO5Q9H790 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXO5Q9H790 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXO5Q9H790 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXO5Q9H790 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXO5Q9H790 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXO5Q9H790 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXO5Q9H790 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXO5Q9H790 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EXO5Q9H790 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXO5Q9H790 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXO5Q9H790 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXO5Q9H790 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXO5Q9H790 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXO5Q9H790 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EXO5Q9H790 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXO5Q9H790 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXO5Q9H790 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXO5Q9H790 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXO5Q9H790 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXO5Q9H790 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXO5Q9H790 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXO5Q9H790 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXO5Q9H790 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EXO5Q9H790 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXO5Q9H790 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXO5Q9H790 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXO5Q9H790 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXO5Q9H790 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXO5Q9H790 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXO5Q9H790 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
EXO5Q9H790 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXO5Q9H790 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXO5Q9H790 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXO5Q9H790 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXO5Q9H790 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXO5Q9H790 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXO5Q9H790 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXO5Q9H790 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXO5Q9H790 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXO5Q9H790 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXO5Q9H790 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXO5Q9H790 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EXO5Q9H790 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EXO5Q9H790 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EXO5Q9H790 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXO5Q9H790 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXO5Q9H790 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXO5Q9H790 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXO5Q9H790 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXO5Q9H790 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXO5Q9H790 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXO5Q9H790 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXO5Q9H790 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXO5Q9H790 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXO5Q9H790 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXO5Q9H790 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXO5Q9H790 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EXO5Q9H790 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXO5Q9H790 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXO5Q9H790 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXO5Q9H790 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EXO5Q9H790 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EXO5Q9H790 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXO5Q9H790 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXO5Q9H790 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXO5Q9H790 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXO5Q9H790 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXO5Q9H790 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXO5Q9H790 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXO5Q9H790 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EXO5Q9H790 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXO5Q9H790 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXO5Q9H790 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXO5Q9H790 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXO5Q9H790 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXO5Q9H790 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXO5Q9H790 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms