Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5N1

RABEP2, Rab GTPase-binding effector protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP2Q9H5N1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RABEP2Q9H5N1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RABEP2Q9H5N1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RABEP2Q9H5N1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RABEP2Q9H5N1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RABEP2Q9H5N1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RABEP2Q9H5N1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RABEP2Q9H5N1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RABEP2Q9H5N1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RABEP2Q9H5N1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RABEP2Q9H5N1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RABEP2Q9H5N1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RABEP2Q9H5N1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RABEP2Q9H5N1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABEP2Q9H5N1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABEP2Q9H5N1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABEP2Q9H5N1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABEP2Q9H5N1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABEP2Q9H5N1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABEP2Q9H5N1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABEP2Q9H5N1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABEP2Q9H5N1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABEP2Q9H5N1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABEP2Q9H5N1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABEP2Q9H5N1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABEP2Q9H5N1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABEP2Q9H5N1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RABEP2Q9H5N1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RABEP2Q9H5N1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RABEP2Q9H5N1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RABEP2Q9H5N1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RABEP2Q9H5N1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RABEP2Q9H5N1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RABEP2Q9H5N1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABEP2Q9H5N1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABEP2Q9H5N1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABEP2Q9H5N1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABEP2Q9H5N1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABEP2Q9H5N1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RABEP2Q9H5N1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RABEP2Q9H5N1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RABEP2Q9H5N1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RABEP2Q9H5N1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RABEP2Q9H5N1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RABEP2Q9H5N1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RABEP2Q9H5N1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RABEP2Q9H5N1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RABEP2Q9H5N1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABEP2Q9H5N1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABEP2Q9H5N1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABEP2Q9H5N1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABEP2Q9H5N1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABEP2Q9H5N1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABEP2Q9H5N1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABEP2Q9H5N1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RABEP2Q9H5N1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RABEP2Q9H5N1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RABEP2Q9H5N1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABEP2Q9H5N1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABEP2Q9H5N1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABEP2Q9H5N1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABEP2Q9H5N1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABEP2Q9H5N1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABEP2Q9H5N1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RABEP2Q9H5N1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RABEP2Q9H5N1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RABEP2Q9H5N1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABEP2Q9H5N1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABEP2Q9H5N1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABEP2Q9H5N1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABEP2Q9H5N1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RABEP2Q9H5N1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABEP2Q9H5N1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABEP2Q9H5N1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RABEP2Q9H5N1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABEP2Q9H5N1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RABEP2Q9H5N1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABEP2Q9H5N1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABEP2Q9H5N1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABEP2Q9H5N1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABEP2Q9H5N1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABEP2Q9H5N1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABEP2Q9H5N1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABEP2Q9H5N1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABEP2Q9H5N1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABEP2Q9H5N1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RABEP2Q9H5N1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RABEP2Q9H5N1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABEP2Q9H5N1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RABEP2Q9H5N1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RABEP2Q9H5N1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABEP2Q9H5N1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABEP2Q9H5N1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABEP2Q9H5N1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABEP2Q9H5N1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABEP2Q9H5N1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABEP2Q9H5N1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABEP2Q9H5N1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABEP2Q9H5N1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABEP2Q9H5N1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
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