Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PDGFDQ9GZP0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PDGFDQ9GZP0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PDGFDQ9GZP0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PDGFDQ9GZP0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PDGFDQ9GZP0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PDGFDQ9GZP0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PDGFDQ9GZP0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PDGFDQ9GZP0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
PDGFDQ9GZP0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PDGFDQ9GZP0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PDGFDQ9GZP0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PDGFDQ9GZP0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PDGFDQ9GZP0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PDGFDQ9GZP0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PDGFDQ9GZP0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PDGFDQ9GZP0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PDGFDQ9GZP0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PDGFDQ9GZP0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PDGFDQ9GZP0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PDGFDQ9GZP0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PDGFDQ9GZP0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PDGFDQ9GZP0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PDGFDQ9GZP0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PDGFDQ9GZP0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
PDGFDQ9GZP0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PDGFDQ9GZP0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
PDGFDQ9GZP0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
PDGFDQ9GZP0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PDGFDQ9GZP0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PDGFDQ9GZP0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PDGFDQ9GZP0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
PDGFDQ9GZP0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PDGFDQ9GZP0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PDGFDQ9GZP0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PDGFDQ9GZP0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PDGFDQ9GZP0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PDGFDQ9GZP0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PDGFDQ9GZP0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PDGFDQ9GZP0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PDGFDQ9GZP0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PDGFDQ9GZP0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PDGFDQ9GZP0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
PDGFDQ9GZP0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PDGFDQ9GZP0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PDGFDQ9GZP0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PDGFDQ9GZP0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
PDGFDQ9GZP0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PDGFDQ9GZP0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PDGFDQ9GZP0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
PDGFDQ9GZP0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PDGFDQ9GZP0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PDGFDQ9GZP0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PDGFDQ9GZP0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PDGFDQ9GZP0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PDGFDQ9GZP0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PDGFDQ9GZP0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PDGFDQ9GZP0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PDGFDQ9GZP0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PDGFDQ9GZP0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PDGFDQ9GZP0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
PDGFDQ9GZP0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PDGFDQ9GZP0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
PDGFDQ9GZP0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PDGFDQ9GZP0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PDGFDQ9GZP0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PDGFDQ9GZP0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PDGFDQ9GZP0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PDGFDQ9GZP0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PDGFDQ9GZP0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PDGFDQ9GZP0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PDGFDQ9GZP0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PDGFDQ9GZP0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PDGFDQ9GZP0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
PDGFDQ9GZP0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PDGFDQ9GZP0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
PDGFDQ9GZP0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PDGFDQ9GZP0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PDGFDQ9GZP0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PDGFDQ9GZP0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PDGFDQ9GZP0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PDGFDQ9GZP0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PDGFDQ9GZP0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PDGFDQ9GZP0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PDGFDQ9GZP0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PDGFDQ9GZP0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PDGFDQ9GZP0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PDGFDQ9GZP0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PDGFDQ9GZP0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PDGFDQ9GZP0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PDGFDQ9GZP0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PDGFDQ9GZP0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PDGFDQ9GZP0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PDGFDQ9GZP0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PDGFDQ9GZP0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PDGFDQ9GZP0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PDGFDQ9GZP0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PDGFDQ9GZP0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PDGFDQ9GZP0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PDGFDQ9GZP0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms