Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZV1

UBXN6, UBX domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6Q9BZV1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBXN6Q9BZV1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBXN6Q9BZV1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBXN6Q9BZV1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBXN6Q9BZV1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBXN6Q9BZV1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBXN6Q9BZV1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBXN6Q9BZV1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
UBXN6Q9BZV1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
UBXN6Q9BZV1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
UBXN6Q9BZV1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
UBXN6Q9BZV1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
UBXN6Q9BZV1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBXN6Q9BZV1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
UBXN6Q9BZV1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBXN6Q9BZV1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBXN6Q9BZV1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBXN6Q9BZV1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBXN6Q9BZV1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
UBXN6Q9BZV1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBXN6Q9BZV1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBXN6Q9BZV1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBXN6Q9BZV1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBXN6Q9BZV1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBXN6Q9BZV1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBXN6Q9BZV1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBXN6Q9BZV1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBXN6Q9BZV1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBXN6Q9BZV1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBXN6Q9BZV1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBXN6Q9BZV1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBXN6Q9BZV1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN6Q9BZV1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN6Q9BZV1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN6Q9BZV1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN6Q9BZV1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN6Q9BZV1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN6Q9BZV1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN6Q9BZV1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN6Q9BZV1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBXN6Q9BZV1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBXN6Q9BZV1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
UBXN6Q9BZV1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBXN6Q9BZV1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBXN6Q9BZV1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
UBXN6Q9BZV1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
UBXN6Q9BZV1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBXN6Q9BZV1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBXN6Q9BZV1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBXN6Q9BZV1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBXN6Q9BZV1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBXN6Q9BZV1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBXN6Q9BZV1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBXN6Q9BZV1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBXN6Q9BZV1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
UBXN6Q9BZV1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
UBXN6Q9BZV1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
UBXN6Q9BZV1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
UBXN6Q9BZV1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBXN6Q9BZV1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBXN6Q9BZV1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBXN6Q9BZV1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms