Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCO2Q9BYV7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCO2Q9BYV7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCO2Q9BYV7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BCO2Q9BYV7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCO2Q9BYV7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCO2Q9BYV7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCO2Q9BYV7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCO2Q9BYV7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCO2Q9BYV7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCO2Q9BYV7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCO2Q9BYV7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCO2Q9BYV7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
BCO2Q9BYV7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCO2Q9BYV7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCO2Q9BYV7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCO2Q9BYV7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCO2Q9BYV7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCO2Q9BYV7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCO2Q9BYV7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCO2Q9BYV7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCO2Q9BYV7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCO2Q9BYV7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCO2Q9BYV7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCO2Q9BYV7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCO2Q9BYV7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCO2Q9BYV7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCO2Q9BYV7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCO2Q9BYV7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCO2Q9BYV7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
BCO2Q9BYV7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCO2Q9BYV7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCO2Q9BYV7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCO2Q9BYV7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCO2Q9BYV7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BCO2Q9BYV7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BCO2Q9BYV7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCO2Q9BYV7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCO2Q9BYV7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCO2Q9BYV7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCO2Q9BYV7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCO2Q9BYV7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCO2Q9BYV7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCO2Q9BYV7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCO2Q9BYV7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCO2Q9BYV7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCO2Q9BYV7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCO2Q9BYV7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCO2Q9BYV7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCO2Q9BYV7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
BCO2Q9BYV7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BCO2Q9BYV7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BCO2Q9BYV7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
BCO2Q9BYV7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BCO2Q9BYV7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCO2Q9BYV7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCO2Q9BYV7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCO2Q9BYV7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCO2Q9BYV7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCO2Q9BYV7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCO2Q9BYV7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCO2Q9BYV7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCO2Q9BYV7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BCO2Q9BYV7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BCO2Q9BYV7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BCO2Q9BYV7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BCO2Q9BYV7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BCO2Q9BYV7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCO2Q9BYV7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCO2Q9BYV7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCO2Q9BYV7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
BCO2Q9BYV7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
BCO2Q9BYV7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCO2Q9BYV7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BCO2Q9BYV7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BCO2Q9BYV7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BCO2Q9BYV7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCO2Q9BYV7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCO2Q9BYV7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCO2Q9BYV7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCO2Q9BYV7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BCO2Q9BYV7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BCO2Q9BYV7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BCO2Q9BYV7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BCO2Q9BYV7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
BCO2Q9BYV7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BCO2Q9BYV7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BCO2Q9BYV7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BCO2Q9BYV7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BCO2Q9BYV7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
BCO2Q9BYV7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BCO2Q9BYV7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BCO2Q9BYV7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BCO2Q9BYV7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
BCO2Q9BYV7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BCO2Q9BYV7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BCO2Q9BYV7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BCO2Q9BYV7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BCO2Q9BYV7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BCO2Q9BYV7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms