Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX95

SGPP1, Sphingosine-1-phosphate phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGPP1Q9BX95 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGPP1Q9BX95 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SGPP1Q9BX95 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGPP1Q9BX95 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGPP1Q9BX95 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGPP1Q9BX95 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGPP1Q9BX95 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SGPP1Q9BX95 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGPP1Q9BX95 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGPP1Q9BX95 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGPP1Q9BX95 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGPP1Q9BX95 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SGPP1Q9BX95 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGPP1Q9BX95 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGPP1Q9BX95 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGPP1Q9BX95 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGPP1Q9BX95 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGPP1Q9BX95 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SGPP1Q9BX95 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SGPP1Q9BX95 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGPP1Q9BX95 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGPP1Q9BX95 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGPP1Q9BX95 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGPP1Q9BX95 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SGPP1Q9BX95 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SGPP1Q9BX95 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGPP1Q9BX95 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGPP1Q9BX95 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGPP1Q9BX95 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGPP1Q9BX95 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGPP1Q9BX95 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGPP1Q9BX95 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGPP1Q9BX95 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGPP1Q9BX95 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGPP1Q9BX95 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGPP1Q9BX95 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGPP1Q9BX95 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SGPP1Q9BX95 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGPP1Q9BX95 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGPP1Q9BX95 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGPP1Q9BX95 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGPP1Q9BX95 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGPP1Q9BX95 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGPP1Q9BX95 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGPP1Q9BX95 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGPP1Q9BX95 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SGPP1Q9BX95 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGPP1Q9BX95 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGPP1Q9BX95 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGPP1Q9BX95 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGPP1Q9BX95 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGPP1Q9BX95 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGPP1Q9BX95 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGPP1Q9BX95 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGPP1Q9BX95 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGPP1Q9BX95 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGPP1Q9BX95 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGPP1Q9BX95 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGPP1Q9BX95 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGPP1Q9BX95 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGPP1Q9BX95 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGPP1Q9BX95 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGPP1Q9BX95 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGPP1Q9BX95 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGPP1Q9BX95 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SGPP1Q9BX95 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGPP1Q9BX95 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SGPP1Q9BX95 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGPP1Q9BX95 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGPP1Q9BX95 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGPP1Q9BX95 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGPP1Q9BX95 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SGPP1Q9BX95 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SGPP1Q9BX95 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGPP1Q9BX95 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGPP1Q9BX95 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGPP1Q9BX95 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGPP1Q9BX95 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGPP1Q9BX95 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGPP1Q9BX95 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGPP1Q9BX95 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGPP1Q9BX95 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGPP1Q9BX95 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGPP1Q9BX95 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGPP1Q9BX95 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGPP1Q9BX95 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGPP1Q9BX95 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGPP1Q9BX95 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGPP1Q9BX95 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SGPP1Q9BX95 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGPP1Q9BX95 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGPP1Q9BX95 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGPP1Q9BX95 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGPP1Q9BX95 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGPP1Q9BX95 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGPP1Q9BX95 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGPP1Q9BX95 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGPP1Q9BX95 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGPP1Q9BX95 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGPP1Q9BX95 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms