Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAIPQ9BWF2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAIPQ9BWF2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAIPQ9BWF2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAIPQ9BWF2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAIPQ9BWF2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAIPQ9BWF2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAIPQ9BWF2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAIPQ9BWF2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAIPQ9BWF2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAIPQ9BWF2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAIPQ9BWF2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRAIPQ9BWF2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRAIPQ9BWF2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAIPQ9BWF2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAIPQ9BWF2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAIPQ9BWF2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAIPQ9BWF2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAIPQ9BWF2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAIPQ9BWF2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAIPQ9BWF2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAIPQ9BWF2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAIPQ9BWF2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAIPQ9BWF2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TRAIPQ9BWF2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAIPQ9BWF2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAIPQ9BWF2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAIPQ9BWF2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAIPQ9BWF2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAIPQ9BWF2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAIPQ9BWF2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAIPQ9BWF2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAIPQ9BWF2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAIPQ9BWF2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAIPQ9BWF2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAIPQ9BWF2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAIPQ9BWF2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAIPQ9BWF2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAIPQ9BWF2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TRAIPQ9BWF2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAIPQ9BWF2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAIPQ9BWF2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAIPQ9BWF2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAIPQ9BWF2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAIPQ9BWF2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAIPQ9BWF2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAIPQ9BWF2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAIPQ9BWF2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAIPQ9BWF2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAIPQ9BWF2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAIPQ9BWF2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAIPQ9BWF2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAIPQ9BWF2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAIPQ9BWF2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAIPQ9BWF2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAIPQ9BWF2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAIPQ9BWF2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAIPQ9BWF2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAIPQ9BWF2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAIPQ9BWF2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAIPQ9BWF2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAIPQ9BWF2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAIPQ9BWF2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAIPQ9BWF2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAIPQ9BWF2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAIPQ9BWF2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAIPQ9BWF2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAIPQ9BWF2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAIPQ9BWF2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAIPQ9BWF2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAIPQ9BWF2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAIPQ9BWF2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAIPQ9BWF2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAIPQ9BWF2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAIPQ9BWF2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAIPQ9BWF2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAIPQ9BWF2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAIPQ9BWF2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAIPQ9BWF2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAIPQ9BWF2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAIPQ9BWF2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAIPQ9BWF2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAIPQ9BWF2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAIPQ9BWF2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAIPQ9BWF2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAIPQ9BWF2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAIPQ9BWF2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAIPQ9BWF2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAIPQ9BWF2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAIPQ9BWF2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAIPQ9BWF2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAIPQ9BWF2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAIPQ9BWF2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAIPQ9BWF2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAIPQ9BWF2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAIPQ9BWF2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAIPQ9BWF2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAIPQ9BWF2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAIPQ9BWF2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAIPQ9BWF2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms