Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW19

KIFC1, Kinesin-like protein KIFC1, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC1Q9BW19 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIFC1Q9BW19 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIFC1Q9BW19 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIFC1Q9BW19 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIFC1Q9BW19 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIFC1Q9BW19 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIFC1Q9BW19 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIFC1Q9BW19 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIFC1Q9BW19 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIFC1Q9BW19 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIFC1Q9BW19 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIFC1Q9BW19 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIFC1Q9BW19 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIFC1Q9BW19 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIFC1Q9BW19 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIFC1Q9BW19 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIFC1Q9BW19 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIFC1Q9BW19 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIFC1Q9BW19 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIFC1Q9BW19 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIFC1Q9BW19 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIFC1Q9BW19 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIFC1Q9BW19 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIFC1Q9BW19 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIFC1Q9BW19 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIFC1Q9BW19 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIFC1Q9BW19 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIFC1Q9BW19 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIFC1Q9BW19 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIFC1Q9BW19 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIFC1Q9BW19 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIFC1Q9BW19 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIFC1Q9BW19 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIFC1Q9BW19 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIFC1Q9BW19 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIFC1Q9BW19 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIFC1Q9BW19 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIFC1Q9BW19 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIFC1Q9BW19 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIFC1Q9BW19 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIFC1Q9BW19 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIFC1Q9BW19 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIFC1Q9BW19 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIFC1Q9BW19 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIFC1Q9BW19 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIFC1Q9BW19 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KIFC1Q9BW19 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KIFC1Q9BW19 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIFC1Q9BW19 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIFC1Q9BW19 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIFC1Q9BW19 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIFC1Q9BW19 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KIFC1Q9BW19 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIFC1Q9BW19 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIFC1Q9BW19 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KIFC1Q9BW19 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIFC1Q9BW19 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIFC1Q9BW19 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIFC1Q9BW19 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIFC1Q9BW19 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIFC1Q9BW19 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIFC1Q9BW19 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KIFC1Q9BW19 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIFC1Q9BW19 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIFC1Q9BW19 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIFC1Q9BW19 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIFC1Q9BW19 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KIFC1Q9BW19 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KIFC1Q9BW19 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIFC1Q9BW19 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KIFC1Q9BW19 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KIFC1Q9BW19 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KIFC1Q9BW19 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KIFC1Q9BW19 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIFC1Q9BW19 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIFC1Q9BW19 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIFC1Q9BW19 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIFC1Q9BW19 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIFC1Q9BW19 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIFC1Q9BW19 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIFC1Q9BW19 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIFC1Q9BW19 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIFC1Q9BW19 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIFC1Q9BW19 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIFC1Q9BW19 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIFC1Q9BW19 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIFC1Q9BW19 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIFC1Q9BW19 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIFC1Q9BW19 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIFC1Q9BW19 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIFC1Q9BW19 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KIFC1Q9BW19 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KIFC1Q9BW19 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KIFC1Q9BW19 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KIFC1Q9BW19 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KIFC1Q9BW19 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KIFC1Q9BW19 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIFC1Q9BW19 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIFC1Q9BW19 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIFC1Q9BW19 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms