Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYT11Q9BT88 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYT11Q9BT88 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYT11Q9BT88 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYT11Q9BT88 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYT11Q9BT88 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYT11Q9BT88 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYT11Q9BT88 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYT11Q9BT88 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYT11Q9BT88 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYT11Q9BT88 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYT11Q9BT88 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYT11Q9BT88 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYT11Q9BT88 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYT11Q9BT88 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYT11Q9BT88 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYT11Q9BT88 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYT11Q9BT88 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYT11Q9BT88 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYT11Q9BT88 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYT11Q9BT88 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SYT11Q9BT88 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYT11Q9BT88 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYT11Q9BT88 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYT11Q9BT88 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYT11Q9BT88 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYT11Q9BT88 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYT11Q9BT88 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYT11Q9BT88 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYT11Q9BT88 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYT11Q9BT88 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYT11Q9BT88 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYT11Q9BT88 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYT11Q9BT88 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYT11Q9BT88 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SYT11Q9BT88 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYT11Q9BT88 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYT11Q9BT88 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYT11Q9BT88 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYT11Q9BT88 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYT11Q9BT88 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYT11Q9BT88 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYT11Q9BT88 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SYT11Q9BT88 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYT11Q9BT88 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYT11Q9BT88 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYT11Q9BT88 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYT11Q9BT88 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYT11Q9BT88 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYT11Q9BT88 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYT11Q9BT88 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYT11Q9BT88 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SYT11Q9BT88 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYT11Q9BT88 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYT11Q9BT88 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYT11Q9BT88 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYT11Q9BT88 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYT11Q9BT88 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYT11Q9BT88 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYT11Q9BT88 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYT11Q9BT88 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYT11Q9BT88 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYT11Q9BT88 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT11Q9BT88 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT11Q9BT88 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT11Q9BT88 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT11Q9BT88 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT11Q9BT88 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT11Q9BT88 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT11Q9BT88 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYT11Q9BT88 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYT11Q9BT88 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYT11Q9BT88 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYT11Q9BT88 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYT11Q9BT88 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYT11Q9BT88 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT11Q9BT88 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT11Q9BT88 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYT11Q9BT88 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYT11Q9BT88 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYT11Q9BT88 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYT11Q9BT88 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYT11Q9BT88 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT11Q9BT88 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT11Q9BT88 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT11Q9BT88 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT11Q9BT88 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT11Q9BT88 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYT11Q9BT88 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYT11Q9BT88 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYT11Q9BT88 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYT11Q9BT88 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYT11Q9BT88 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYT11Q9BT88 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYT11Q9BT88 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYT11Q9BT88 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYT11Q9BT88 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYT11Q9BT88 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYT11Q9BT88 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYT11Q9BT88 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.2 ms