Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTP3Q9BQQ7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RTP3Q9BQQ7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTP3Q9BQQ7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTP3Q9BQQ7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RTP3Q9BQQ7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RTP3Q9BQQ7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RTP3Q9BQQ7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RTP3Q9BQQ7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTP3Q9BQQ7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTP3Q9BQQ7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTP3Q9BQQ7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RTP3Q9BQQ7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTP3Q9BQQ7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTP3Q9BQQ7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTP3Q9BQQ7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTP3Q9BQQ7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTP3Q9BQQ7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTP3Q9BQQ7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTP3Q9BQQ7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTP3Q9BQQ7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTP3Q9BQQ7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTP3Q9BQQ7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTP3Q9BQQ7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTP3Q9BQQ7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTP3Q9BQQ7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTP3Q9BQQ7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTP3Q9BQQ7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTP3Q9BQQ7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RTP3Q9BQQ7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RTP3Q9BQQ7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RTP3Q9BQQ7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RTP3Q9BQQ7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RTP3Q9BQQ7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RTP3Q9BQQ7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RTP3Q9BQQ7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RTP3Q9BQQ7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RTP3Q9BQQ7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RTP3Q9BQQ7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RTP3Q9BQQ7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RTP3Q9BQQ7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RTP3Q9BQQ7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RTP3Q9BQQ7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTP3Q9BQQ7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTP3Q9BQQ7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTP3Q9BQQ7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTP3Q9BQQ7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RTP3Q9BQQ7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RTP3Q9BQQ7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RTP3Q9BQQ7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RTP3Q9BQQ7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RTP3Q9BQQ7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RTP3Q9BQQ7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTP3Q9BQQ7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTP3Q9BQQ7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTP3Q9BQQ7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTP3Q9BQQ7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTP3Q9BQQ7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTP3Q9BQQ7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RTP3Q9BQQ7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTP3Q9BQQ7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTP3Q9BQQ7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTP3Q9BQQ7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTP3Q9BQQ7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RTP3Q9BQQ7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTP3Q9BQQ7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTP3Q9BQQ7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTP3Q9BQQ7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTP3Q9BQQ7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTP3Q9BQQ7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTP3Q9BQQ7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTP3Q9BQQ7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTP3Q9BQQ7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTP3Q9BQQ7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTP3Q9BQQ7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTP3Q9BQQ7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTP3Q9BQQ7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTP3Q9BQQ7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTP3Q9BQQ7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTP3Q9BQQ7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTP3Q9BQQ7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTP3Q9BQQ7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTP3Q9BQQ7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RTP3Q9BQQ7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTP3Q9BQQ7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTP3Q9BQQ7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTP3Q9BQQ7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTP3Q9BQQ7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTP3Q9BQQ7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTP3Q9BQQ7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTP3Q9BQQ7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTP3Q9BQQ7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTP3Q9BQQ7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTP3Q9BQQ7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTP3Q9BQQ7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTP3Q9BQQ7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RTP3Q9BQQ7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTP3Q9BQQ7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTP3Q9BQQ7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTP3Q9BQQ7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms