Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LPIN3Q9BQK8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LPIN3Q9BQK8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LPIN3Q9BQK8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LPIN3Q9BQK8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LPIN3Q9BQK8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LPIN3Q9BQK8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LPIN3Q9BQK8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LPIN3Q9BQK8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LPIN3Q9BQK8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LPIN3Q9BQK8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LPIN3Q9BQK8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LPIN3Q9BQK8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LPIN3Q9BQK8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LPIN3Q9BQK8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LPIN3Q9BQK8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LPIN3Q9BQK8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LPIN3Q9BQK8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LPIN3Q9BQK8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LPIN3Q9BQK8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LPIN3Q9BQK8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LPIN3Q9BQK8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LPIN3Q9BQK8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LPIN3Q9BQK8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LPIN3Q9BQK8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LPIN3Q9BQK8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LPIN3Q9BQK8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LPIN3Q9BQK8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LPIN3Q9BQK8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LPIN3Q9BQK8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LPIN3Q9BQK8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LPIN3Q9BQK8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LPIN3Q9BQK8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LPIN3Q9BQK8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LPIN3Q9BQK8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LPIN3Q9BQK8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LPIN3Q9BQK8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LPIN3Q9BQK8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LPIN3Q9BQK8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LPIN3Q9BQK8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LPIN3Q9BQK8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LPIN3Q9BQK8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LPIN3Q9BQK8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LPIN3Q9BQK8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LPIN3Q9BQK8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LPIN3Q9BQK8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LPIN3Q9BQK8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LPIN3Q9BQK8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LPIN3Q9BQK8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LPIN3Q9BQK8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LPIN3Q9BQK8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LPIN3Q9BQK8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LPIN3Q9BQK8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LPIN3Q9BQK8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LPIN3Q9BQK8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LPIN3Q9BQK8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LPIN3Q9BQK8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LPIN3Q9BQK8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LPIN3Q9BQK8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LPIN3Q9BQK8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LPIN3Q9BQK8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LPIN3Q9BQK8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LPIN3Q9BQK8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LPIN3Q9BQK8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LPIN3Q9BQK8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LPIN3Q9BQK8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LPIN3Q9BQK8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LPIN3Q9BQK8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LPIN3Q9BQK8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LPIN3Q9BQK8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LPIN3Q9BQK8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LPIN3Q9BQK8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LPIN3Q9BQK8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LPIN3Q9BQK8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LPIN3Q9BQK8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LPIN3Q9BQK8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LPIN3Q9BQK8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LPIN3Q9BQK8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LPIN3Q9BQK8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LPIN3Q9BQK8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LPIN3Q9BQK8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LPIN3Q9BQK8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LPIN3Q9BQK8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LPIN3Q9BQK8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LPIN3Q9BQK8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LPIN3Q9BQK8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LPIN3Q9BQK8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LPIN3Q9BQK8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LPIN3Q9BQK8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LPIN3Q9BQK8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LPIN3Q9BQK8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LPIN3Q9BQK8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LPIN3Q9BQK8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LPIN3Q9BQK8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LPIN3Q9BQK8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LPIN3Q9BQK8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LPIN3Q9BQK8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LPIN3Q9BQK8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LPIN3Q9BQK8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LPIN3Q9BQK8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms