Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSG101Q99816 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSG101Q99816 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSG101Q99816 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TSG101Q99816 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TSG101Q99816 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TSG101Q99816 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TSG101Q99816 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TSG101Q99816 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TSG101Q99816 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TSG101Q99816 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSG101Q99816 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSG101Q99816 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSG101Q99816 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSG101Q99816 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSG101Q99816 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSG101Q99816 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSG101Q99816 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSG101Q99816 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSG101Q99816 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSG101Q99816 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSG101Q99816 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSG101Q99816 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSG101Q99816 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSG101Q99816 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSG101Q99816 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSG101Q99816 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSG101Q99816 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSG101Q99816 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSG101Q99816 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSG101Q99816 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSG101Q99816 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSG101Q99816 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSG101Q99816 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSG101Q99816 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSG101Q99816 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSG101Q99816 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSG101Q99816 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TSG101Q99816 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TSG101Q99816 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TSG101Q99816 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSG101Q99816 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSG101Q99816 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSG101Q99816 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSG101Q99816 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSG101Q99816 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSG101Q99816 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSG101Q99816 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TSG101Q99816 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TSG101Q99816 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TSG101Q99816 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSG101Q99816 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSG101Q99816 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSG101Q99816 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSG101Q99816 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSG101Q99816 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSG101Q99816 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSG101Q99816 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSG101Q99816 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSG101Q99816 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSG101Q99816 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSG101Q99816 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSG101Q99816 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TSG101Q99816 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TSG101Q99816 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TSG101Q99816 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TSG101Q99816 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TSG101Q99816 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
TSG101Q99816 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TSG101Q99816 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
TSG101Q99816 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TSG101Q99816 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TSG101Q99816 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TSG101Q99816 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TSG101Q99816 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TSG101Q99816 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TSG101Q99816 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TSG101Q99816 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TSG101Q99816 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TSG101Q99816 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TSG101Q99816 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TSG101Q99816 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TSG101Q99816 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
TSG101Q99816 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TSG101Q99816 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TSG101Q99816 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TSG101Q99816 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSG101Q99816 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSG101Q99816 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSG101Q99816 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSG101Q99816 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSG101Q99816 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSG101Q99816 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSG101Q99816 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSG101Q99816 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSG101Q99816 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSG101Q99816 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSG101Q99816 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSG101Q99816 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSG101Q99816 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms