Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBBP8Q99708 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBBP8Q99708 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBBP8Q99708 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBBP8Q99708 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBBP8Q99708 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBBP8Q99708 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBBP8Q99708 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP8Q99708 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP8Q99708 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP8Q99708 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP8Q99708 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP8Q99708 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP8Q99708 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP8Q99708 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP8Q99708 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP8Q99708 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBBP8Q99708 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RBBP8Q99708 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBBP8Q99708 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBBP8Q99708 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBBP8Q99708 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBBP8Q99708 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBBP8Q99708 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBBP8Q99708 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBBP8Q99708 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBBP8Q99708 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBBP8Q99708 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBBP8Q99708 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBBP8Q99708 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBBP8Q99708 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBBP8Q99708 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBBP8Q99708 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBBP8Q99708 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBBP8Q99708 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBBP8Q99708 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBBP8Q99708 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBBP8Q99708 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBBP8Q99708 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBBP8Q99708 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBBP8Q99708 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBBP8Q99708 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBBP8Q99708 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RBBP8Q99708 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBBP8Q99708 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBBP8Q99708 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBBP8Q99708 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBBP8Q99708 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBBP8Q99708 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBBP8Q99708 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBBP8Q99708 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBBP8Q99708 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBBP8Q99708 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBBP8Q99708 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBBP8Q99708 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBBP8Q99708 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBBP8Q99708 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RBBP8Q99708 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RBBP8Q99708 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RBBP8Q99708 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBBP8Q99708 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RBBP8Q99708 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RBBP8Q99708 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBBP8Q99708 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBBP8Q99708 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBBP8Q99708 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBBP8Q99708 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBBP8Q99708 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBBP8Q99708 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RBBP8Q99708 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBBP8Q99708 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBBP8Q99708 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBBP8Q99708 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBBP8Q99708 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBBP8Q99708 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBBP8Q99708 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBBP8Q99708 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBBP8Q99708 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBBP8Q99708 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBBP8Q99708 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBBP8Q99708 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBBP8Q99708 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBBP8Q99708 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBBP8Q99708 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBBP8Q99708 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBBP8Q99708 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBBP8Q99708 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBBP8Q99708 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBBP8Q99708 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBBP8Q99708 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBBP8Q99708 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RBBP8Q99708 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBBP8Q99708 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RBBP8Q99708 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBBP8Q99708 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBBP8Q99708 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RBBP8Q99708 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBBP8Q99708 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBBP8Q99708 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBBP8Q99708 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms