Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPS8Q99627 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
COPS8Q99627 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPS8Q99627 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPS8Q99627 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPS8Q99627 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPS8Q99627 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COPS8Q99627 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
COPS8Q99627 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COPS8Q99627 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPS8Q99627 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPS8Q99627 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
COPS8Q99627 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPS8Q99627 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
COPS8Q99627 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPS8Q99627 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPS8Q99627 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPS8Q99627 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPS8Q99627 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPS8Q99627 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPS8Q99627 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPS8Q99627 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPS8Q99627 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
COPS8Q99627 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPS8Q99627 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
COPS8Q99627 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPS8Q99627 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPS8Q99627 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
COPS8Q99627 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPS8Q99627 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPS8Q99627 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPS8Q99627 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPS8Q99627 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPS8Q99627 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPS8Q99627 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPS8Q99627 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPS8Q99627 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPS8Q99627 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPS8Q99627 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPS8Q99627 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPS8Q99627 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COPS8Q99627 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COPS8Q99627 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COPS8Q99627 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COPS8Q99627 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COPS8Q99627 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COPS8Q99627 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPS8Q99627 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COPS8Q99627 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPS8Q99627 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPS8Q99627 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPS8Q99627 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPS8Q99627 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPS8Q99627 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPS8Q99627 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPS8Q99627 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
COPS8Q99627 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPS8Q99627 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPS8Q99627 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPS8Q99627 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPS8Q99627 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPS8Q99627 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPS8Q99627 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPS8Q99627 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPS8Q99627 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPS8Q99627 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPS8Q99627 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPS8Q99627 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPS8Q99627 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
COPS8Q99627 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPS8Q99627 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPS8Q99627 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPS8Q99627 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPS8Q99627 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPS8Q99627 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPS8Q99627 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPS8Q99627 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS8Q99627 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS8Q99627 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS8Q99627 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS8Q99627 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS8Q99627 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS8Q99627 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS8Q99627 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS8Q99627 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS8Q99627 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPS8Q99627 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPS8Q99627 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPS8Q99627 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPS8Q99627 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPS8Q99627 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPS8Q99627 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPS8Q99627 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPS8Q99627 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPS8Q99627 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPS8Q99627 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPS8Q99627 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPS8Q99627 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPS8Q99627 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPS8Q99627 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 288.2 ms