Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LGMNQ99538 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LGMNQ99538 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LGMNQ99538 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LGMNQ99538 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LGMNQ99538 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LGMNQ99538 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LGMNQ99538 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LGMNQ99538 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LGMNQ99538 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LGMNQ99538 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LGMNQ99538 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LGMNQ99538 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LGMNQ99538 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LGMNQ99538 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LGMNQ99538 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LGMNQ99538 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LGMNQ99538 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LGMNQ99538 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LGMNQ99538 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LGMNQ99538 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LGMNQ99538 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LGMNQ99538 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LGMNQ99538 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LGMNQ99538 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LGMNQ99538 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LGMNQ99538 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LGMNQ99538 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LGMNQ99538 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LGMNQ99538 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LGMNQ99538 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LGMNQ99538 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LGMNQ99538 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LGMNQ99538 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LGMNQ99538 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LGMNQ99538 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LGMNQ99538 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LGMNQ99538 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LGMNQ99538 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LGMNQ99538 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LGMNQ99538 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LGMNQ99538 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LGMNQ99538 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LGMNQ99538 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LGMNQ99538 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LGMNQ99538 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LGMNQ99538 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LGMNQ99538 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LGMNQ99538 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LGMNQ99538 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LGMNQ99538 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms