Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF12Q99081 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCF12Q99081 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCF12Q99081 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCF12Q99081 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCF12Q99081 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCF12Q99081 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCF12Q99081 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCF12Q99081 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCF12Q99081 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF12Q99081 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCF12Q99081 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TCF12Q99081 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCF12Q99081 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCF12Q99081 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCF12Q99081 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCF12Q99081 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCF12Q99081 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCF12Q99081 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCF12Q99081 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCF12Q99081 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCF12Q99081 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCF12Q99081 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCF12Q99081 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TCF12Q99081 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TCF12Q99081 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TCF12Q99081 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCF12Q99081 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCF12Q99081 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCF12Q99081 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCF12Q99081 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCF12Q99081 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCF12Q99081 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCF12Q99081 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCF12Q99081 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCF12Q99081 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCF12Q99081 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCF12Q99081 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCF12Q99081 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TCF12Q99081 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCF12Q99081 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCF12Q99081 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCF12Q99081 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCF12Q99081 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCF12Q99081 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCF12Q99081 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCF12Q99081 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCF12Q99081 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCF12Q99081 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCF12Q99081 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCF12Q99081 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCF12Q99081 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCF12Q99081 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCF12Q99081 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCF12Q99081 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCF12Q99081 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCF12Q99081 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCF12Q99081 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCF12Q99081 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TCF12Q99081 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCF12Q99081 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCF12Q99081 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCF12Q99081 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms