Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF3RQ99062 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF3RQ99062 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF3RQ99062 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF3RQ99062 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF3RQ99062 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF3RQ99062 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSF3RQ99062 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSF3RQ99062 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSF3RQ99062 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSF3RQ99062 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CSF3RQ99062 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSF3RQ99062 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSF3RQ99062 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSF3RQ99062 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSF3RQ99062 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CSF3RQ99062 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSF3RQ99062 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSF3RQ99062 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CSF3RQ99062 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSF3RQ99062 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSF3RQ99062 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSF3RQ99062 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CSF3RQ99062 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSF3RQ99062 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSF3RQ99062 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSF3RQ99062 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSF3RQ99062 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSF3RQ99062 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSF3RQ99062 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSF3RQ99062 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSF3RQ99062 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSF3RQ99062 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSF3RQ99062 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CSF3RQ99062 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSF3RQ99062 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSF3RQ99062 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSF3RQ99062 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSF3RQ99062 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSF3RQ99062 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CSF3RQ99062 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSF3RQ99062 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSF3RQ99062 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSF3RQ99062 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSF3RQ99062 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSF3RQ99062 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSF3RQ99062 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSF3RQ99062 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSF3RQ99062 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSF3RQ99062 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF3RQ99062 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF3RQ99062 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF3RQ99062 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF3RQ99062 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF3RQ99062 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF3RQ99062 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF3RQ99062 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF3RQ99062 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF3RQ99062 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF3RQ99062 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF3RQ99062 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF3RQ99062 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSF3RQ99062 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms