Protein–RNA interactions for Protein: Q96RD7

PANX1, Pannexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1Q96RD7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PANX1Q96RD7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PANX1Q96RD7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PANX1Q96RD7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PANX1Q96RD7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PANX1Q96RD7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PANX1Q96RD7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PANX1Q96RD7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PANX1Q96RD7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PANX1Q96RD7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PANX1Q96RD7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PANX1Q96RD7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PANX1Q96RD7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PANX1Q96RD7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PANX1Q96RD7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PANX1Q96RD7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PANX1Q96RD7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PANX1Q96RD7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PANX1Q96RD7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PANX1Q96RD7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PANX1Q96RD7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PANX1Q96RD7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PANX1Q96RD7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PANX1Q96RD7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PANX1Q96RD7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PANX1Q96RD7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PANX1Q96RD7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PANX1Q96RD7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PANX1Q96RD7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PANX1Q96RD7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PANX1Q96RD7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PANX1Q96RD7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PANX1Q96RD7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PANX1Q96RD7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PANX1Q96RD7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PANX1Q96RD7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PANX1Q96RD7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PANX1Q96RD7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PANX1Q96RD7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PANX1Q96RD7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PANX1Q96RD7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PANX1Q96RD7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PANX1Q96RD7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PANX1Q96RD7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PANX1Q96RD7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PANX1Q96RD7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PANX1Q96RD7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PANX1Q96RD7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PANX1Q96RD7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PANX1Q96RD7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PANX1Q96RD7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PANX1Q96RD7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PANX1Q96RD7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PANX1Q96RD7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PANX1Q96RD7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PANX1Q96RD7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PANX1Q96RD7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PANX1Q96RD7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PANX1Q96RD7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PANX1Q96RD7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PANX1Q96RD7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PANX1Q96RD7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PANX1Q96RD7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PANX1Q96RD7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PANX1Q96RD7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PANX1Q96RD7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PANX1Q96RD7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PANX1Q96RD7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PANX1Q96RD7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PANX1Q96RD7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PANX1Q96RD7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PANX1Q96RD7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PANX1Q96RD7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PANX1Q96RD7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PANX1Q96RD7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PANX1Q96RD7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PANX1Q96RD7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PANX1Q96RD7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PANX1Q96RD7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PANX1Q96RD7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PANX1Q96RD7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PANX1Q96RD7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PANX1Q96RD7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PANX1Q96RD7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PANX1Q96RD7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PANX1Q96RD7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PANX1Q96RD7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PANX1Q96RD7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PANX1Q96RD7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PANX1Q96RD7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PANX1Q96RD7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PANX1Q96RD7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PANX1Q96RD7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PANX1Q96RD7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PANX1Q96RD7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PANX1Q96RD7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PANX1Q96RD7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PANX1Q96RD7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PANX1Q96RD7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PANX1Q96RD7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms