Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC38A2Q96QD8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC38A2Q96QD8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC38A2Q96QD8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC38A2Q96QD8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC38A2Q96QD8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC38A2Q96QD8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC38A2Q96QD8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC38A2Q96QD8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A2Q96QD8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A2Q96QD8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A2Q96QD8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A2Q96QD8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A2Q96QD8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A2Q96QD8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A2Q96QD8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A2Q96QD8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A2Q96QD8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A2Q96QD8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC38A2Q96QD8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC38A2Q96QD8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC38A2Q96QD8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC38A2Q96QD8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC38A2Q96QD8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC38A2Q96QD8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC38A2Q96QD8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC38A2Q96QD8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC38A2Q96QD8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC38A2Q96QD8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC38A2Q96QD8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC38A2Q96QD8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC38A2Q96QD8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC38A2Q96QD8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC38A2Q96QD8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC38A2Q96QD8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC38A2Q96QD8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC38A2Q96QD8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC38A2Q96QD8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC38A2Q96QD8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC38A2Q96QD8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC38A2Q96QD8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC38A2Q96QD8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC38A2Q96QD8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC38A2Q96QD8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC38A2Q96QD8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC38A2Q96QD8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC38A2Q96QD8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC38A2Q96QD8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC38A2Q96QD8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC38A2Q96QD8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC38A2Q96QD8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC38A2Q96QD8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC38A2Q96QD8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC38A2Q96QD8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC38A2Q96QD8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC38A2Q96QD8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC38A2Q96QD8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC38A2Q96QD8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms