Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SLC4A9Q96Q91 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SLC4A9Q96Q91 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SLC4A9Q96Q91 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SLC4A9Q96Q91 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SLC4A9Q96Q91 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SLC4A9Q96Q91 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SLC4A9Q96Q91 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SLC4A9Q96Q91 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SLC4A9Q96Q91 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SLC4A9Q96Q91 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SLC4A9Q96Q91 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SLC4A9Q96Q91 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SLC4A9Q96Q91 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
SLC4A9Q96Q91 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SLC4A9Q96Q91 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SLC4A9Q96Q91 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SLC4A9Q96Q91 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SLC4A9Q96Q91 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
SLC4A9Q96Q91 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SLC4A9Q96Q91 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SLC4A9Q96Q91 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SLC4A9Q96Q91 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SLC4A9Q96Q91 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SLC4A9Q96Q91 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SLC4A9Q96Q91 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SLC4A9Q96Q91 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SLC4A9Q96Q91 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
SLC4A9Q96Q91 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SLC4A9Q96Q91 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
SLC4A9Q96Q91 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SLC4A9Q96Q91 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
SLC4A9Q96Q91 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
SLC4A9Q96Q91 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SLC4A9Q96Q91 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SLC4A9Q96Q91 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SLC4A9Q96Q91 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
SLC4A9Q96Q91 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SLC4A9Q96Q91 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SLC4A9Q96Q91 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SLC4A9Q96Q91 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SLC4A9Q96Q91 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SLC4A9Q96Q91 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SLC4A9Q96Q91 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SLC4A9Q96Q91 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SLC4A9Q96Q91 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SLC4A9Q96Q91 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SLC4A9Q96Q91 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
SLC4A9Q96Q91 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SLC4A9Q96Q91 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SLC4A9Q96Q91 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SLC4A9Q96Q91 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SLC4A9Q96Q91 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SLC4A9Q96Q91 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SLC4A9Q96Q91 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SLC4A9Q96Q91 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
SLC4A9Q96Q91 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SLC4A9Q96Q91 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SLC4A9Q96Q91 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
SLC4A9Q96Q91 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
SLC4A9Q96Q91 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SLC4A9Q96Q91 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SLC4A9Q96Q91 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SLC4A9Q96Q91 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SLC4A9Q96Q91 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SLC4A9Q96Q91 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SLC4A9Q96Q91 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SLC4A9Q96Q91 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SLC4A9Q96Q91 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SLC4A9Q96Q91 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SLC4A9Q96Q91 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SLC4A9Q96Q91 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SLC4A9Q96Q91 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SLC4A9Q96Q91 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SLC4A9Q96Q91 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SLC4A9Q96Q91 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SLC4A9Q96Q91 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
SLC4A9Q96Q91 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SLC4A9Q96Q91 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SLC4A9Q96Q91 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SLC4A9Q96Q91 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
SLC4A9Q96Q91 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SLC4A9Q96Q91 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
SLC4A9Q96Q91 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
SLC4A9Q96Q91 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
SLC4A9Q96Q91 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SLC4A9Q96Q91 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SLC4A9Q96Q91 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SLC4A9Q96Q91 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SLC4A9Q96Q91 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SLC4A9Q96Q91 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
SLC4A9Q96Q91 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SLC4A9Q96Q91 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SLC4A9Q96Q91 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SLC4A9Q96Q91 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SLC4A9Q96Q91 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SLC4A9Q96Q91 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SLC4A9Q96Q91 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SLC4A9Q96Q91 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SLC4A9Q96Q91 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms