Protein–RNA interactions for Protein: Q96N53

LINC00167, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00167, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00167Q96N53 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00167Q96N53 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00167Q96N53 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00167Q96N53 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms