Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCMTD1Q96MG8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCMTD1Q96MG8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCMTD1Q96MG8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCMTD1Q96MG8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCMTD1Q96MG8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCMTD1Q96MG8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCMTD1Q96MG8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCMTD1Q96MG8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCMTD1Q96MG8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCMTD1Q96MG8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCMTD1Q96MG8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCMTD1Q96MG8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCMTD1Q96MG8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCMTD1Q96MG8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCMTD1Q96MG8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCMTD1Q96MG8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCMTD1Q96MG8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCMTD1Q96MG8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PCMTD1Q96MG8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PCMTD1Q96MG8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCMTD1Q96MG8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCMTD1Q96MG8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCMTD1Q96MG8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCMTD1Q96MG8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCMTD1Q96MG8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCMTD1Q96MG8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCMTD1Q96MG8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCMTD1Q96MG8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCMTD1Q96MG8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCMTD1Q96MG8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCMTD1Q96MG8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCMTD1Q96MG8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCMTD1Q96MG8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCMTD1Q96MG8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCMTD1Q96MG8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCMTD1Q96MG8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCMTD1Q96MG8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCMTD1Q96MG8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCMTD1Q96MG8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCMTD1Q96MG8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCMTD1Q96MG8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCMTD1Q96MG8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCMTD1Q96MG8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PCMTD1Q96MG8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCMTD1Q96MG8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCMTD1Q96MG8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCMTD1Q96MG8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCMTD1Q96MG8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCMTD1Q96MG8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCMTD1Q96MG8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCMTD1Q96MG8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCMTD1Q96MG8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCMTD1Q96MG8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCMTD1Q96MG8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCMTD1Q96MG8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCMTD1Q96MG8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCMTD1Q96MG8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PCMTD1Q96MG8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCMTD1Q96MG8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCMTD1Q96MG8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCMTD1Q96MG8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCMTD1Q96MG8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCMTD1Q96MG8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCMTD1Q96MG8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCMTD1Q96MG8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCMTD1Q96MG8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCMTD1Q96MG8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCMTD1Q96MG8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PCMTD1Q96MG8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCMTD1Q96MG8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCMTD1Q96MG8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCMTD1Q96MG8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCMTD1Q96MG8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCMTD1Q96MG8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCMTD1Q96MG8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCMTD1Q96MG8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCMTD1Q96MG8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCMTD1Q96MG8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCMTD1Q96MG8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCMTD1Q96MG8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PCMTD1Q96MG8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCMTD1Q96MG8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCMTD1Q96MG8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCMTD1Q96MG8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCMTD1Q96MG8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCMTD1Q96MG8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCMTD1Q96MG8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCMTD1Q96MG8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCMTD1Q96MG8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCMTD1Q96MG8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCMTD1Q96MG8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCMTD1Q96MG8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCMTD1Q96MG8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCMTD1Q96MG8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCMTD1Q96MG8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PCMTD1Q96MG8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PCMTD1Q96MG8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCMTD1Q96MG8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCMTD1Q96MG8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms