Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF354BQ96LW1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF354BQ96LW1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF354BQ96LW1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF354BQ96LW1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF354BQ96LW1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF354BQ96LW1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF354BQ96LW1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF354BQ96LW1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF354BQ96LW1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF354BQ96LW1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF354BQ96LW1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF354BQ96LW1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF354BQ96LW1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF354BQ96LW1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF354BQ96LW1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF354BQ96LW1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF354BQ96LW1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF354BQ96LW1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF354BQ96LW1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF354BQ96LW1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF354BQ96LW1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF354BQ96LW1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF354BQ96LW1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF354BQ96LW1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF354BQ96LW1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF354BQ96LW1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF354BQ96LW1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF354BQ96LW1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF354BQ96LW1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF354BQ96LW1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF354BQ96LW1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF354BQ96LW1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF354BQ96LW1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF354BQ96LW1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF354BQ96LW1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF354BQ96LW1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF354BQ96LW1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF354BQ96LW1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF354BQ96LW1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF354BQ96LW1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF354BQ96LW1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF354BQ96LW1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF354BQ96LW1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF354BQ96LW1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF354BQ96LW1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF354BQ96LW1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF354BQ96LW1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF354BQ96LW1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF354BQ96LW1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF354BQ96LW1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF354BQ96LW1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF354BQ96LW1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF354BQ96LW1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF354BQ96LW1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF354BQ96LW1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF354BQ96LW1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF354BQ96LW1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF354BQ96LW1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF354BQ96LW1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF354BQ96LW1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF354BQ96LW1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF354BQ96LW1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF354BQ96LW1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF354BQ96LW1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF354BQ96LW1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms