Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALPK3Q96L96 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALPK3Q96L96 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALPK3Q96L96 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALPK3Q96L96 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALPK3Q96L96 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALPK3Q96L96 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALPK3Q96L96 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALPK3Q96L96 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ALPK3Q96L96 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ALPK3Q96L96 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALPK3Q96L96 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ALPK3Q96L96 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALPK3Q96L96 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALPK3Q96L96 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALPK3Q96L96 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALPK3Q96L96 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALPK3Q96L96 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALPK3Q96L96 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALPK3Q96L96 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ALPK3Q96L96 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ALPK3Q96L96 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALPK3Q96L96 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALPK3Q96L96 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ALPK3Q96L96 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ALPK3Q96L96 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ALPK3Q96L96 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ALPK3Q96L96 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ALPK3Q96L96 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ALPK3Q96L96 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ALPK3Q96L96 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALPK3Q96L96 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALPK3Q96L96 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALPK3Q96L96 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALPK3Q96L96 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ALPK3Q96L96 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ALPK3Q96L96 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ALPK3Q96L96 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ALPK3Q96L96 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ALPK3Q96L96 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALPK3Q96L96 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALPK3Q96L96 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALPK3Q96L96 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALPK3Q96L96 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALPK3Q96L96 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ALPK3Q96L96 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ALPK3Q96L96 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ALPK3Q96L96 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALPK3Q96L96 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ALPK3Q96L96 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ALPK3Q96L96 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALPK3Q96L96 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ALPK3Q96L96 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALPK3Q96L96 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALPK3Q96L96 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALPK3Q96L96 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALPK3Q96L96 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALPK3Q96L96 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALPK3Q96L96 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALPK3Q96L96 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALPK3Q96L96 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALPK3Q96L96 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ALPK3Q96L96 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALPK3Q96L96 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALPK3Q96L96 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALPK3Q96L96 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALPK3Q96L96 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALPK3Q96L96 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ALPK3Q96L96 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ALPK3Q96L96 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALPK3Q96L96 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALPK3Q96L96 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALPK3Q96L96 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALPK3Q96L96 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALPK3Q96L96 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ALPK3Q96L96 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ALPK3Q96L96 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALPK3Q96L96 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALPK3Q96L96 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALPK3Q96L96 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALPK3Q96L96 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ALPK3Q96L96 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALPK3Q96L96 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALPK3Q96L96 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALPK3Q96L96 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ALPK3Q96L96 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ALPK3Q96L96 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALPK3Q96L96 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALPK3Q96L96 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALPK3Q96L96 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALPK3Q96L96 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALPK3Q96L96 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALPK3Q96L96 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALPK3Q96L96 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALPK3Q96L96 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALPK3Q96L96 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALPK3Q96L96 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALPK3Q96L96 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALPK3Q96L96 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALPK3Q96L96 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms