Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPGRIP1Q96KN7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPGRIP1Q96KN7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPGRIP1Q96KN7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPGRIP1Q96KN7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
RPGRIP1Q96KN7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RPGRIP1Q96KN7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RPGRIP1Q96KN7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
RPGRIP1Q96KN7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPGRIP1Q96KN7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPGRIP1Q96KN7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RPGRIP1Q96KN7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RPGRIP1Q96KN7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RPGRIP1Q96KN7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPGRIP1Q96KN7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RPGRIP1Q96KN7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RPGRIP1Q96KN7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RPGRIP1Q96KN7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RPGRIP1Q96KN7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPGRIP1Q96KN7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPGRIP1Q96KN7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPGRIP1Q96KN7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPGRIP1Q96KN7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPGRIP1Q96KN7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPGRIP1Q96KN7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPGRIP1Q96KN7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPGRIP1Q96KN7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPGRIP1Q96KN7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPGRIP1Q96KN7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPGRIP1Q96KN7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPGRIP1Q96KN7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPGRIP1Q96KN7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPGRIP1Q96KN7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPGRIP1Q96KN7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPGRIP1Q96KN7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPGRIP1Q96KN7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPGRIP1Q96KN7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RPGRIP1Q96KN7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RPGRIP1Q96KN7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RPGRIP1Q96KN7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPGRIP1Q96KN7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPGRIP1Q96KN7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPGRIP1Q96KN7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPGRIP1Q96KN7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPGRIP1Q96KN7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPGRIP1Q96KN7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPGRIP1Q96KN7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPGRIP1Q96KN7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPGRIP1Q96KN7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPGRIP1Q96KN7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPGRIP1Q96KN7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPGRIP1Q96KN7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPGRIP1Q96KN7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPGRIP1Q96KN7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPGRIP1Q96KN7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPGRIP1Q96KN7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPGRIP1Q96KN7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPGRIP1Q96KN7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPGRIP1Q96KN7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPGRIP1Q96KN7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPGRIP1Q96KN7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPGRIP1Q96KN7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPGRIP1Q96KN7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RPGRIP1Q96KN7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPGRIP1Q96KN7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RPGRIP1Q96KN7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPGRIP1Q96KN7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPGRIP1Q96KN7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPGRIP1Q96KN7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPGRIP1Q96KN7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPGRIP1Q96KN7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RPGRIP1Q96KN7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPGRIP1Q96KN7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPGRIP1Q96KN7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPGRIP1Q96KN7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPGRIP1Q96KN7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPGRIP1Q96KN7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPGRIP1Q96KN7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPGRIP1Q96KN7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPGRIP1Q96KN7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPGRIP1Q96KN7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPGRIP1Q96KN7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPGRIP1Q96KN7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPGRIP1Q96KN7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPGRIP1Q96KN7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPGRIP1Q96KN7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPGRIP1Q96KN7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPGRIP1Q96KN7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPGRIP1Q96KN7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPGRIP1Q96KN7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPGRIP1Q96KN7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPGRIP1Q96KN7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPGRIP1Q96KN7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPGRIP1Q96KN7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPGRIP1Q96KN7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPGRIP1Q96KN7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPGRIP1Q96KN7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPGRIP1Q96KN7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPGRIP1Q96KN7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPGRIP1Q96KN7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms