Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHAMP1Q96JM3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHAMP1Q96JM3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHAMP1Q96JM3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHAMP1Q96JM3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHAMP1Q96JM3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHAMP1Q96JM3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHAMP1Q96JM3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHAMP1Q96JM3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHAMP1Q96JM3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHAMP1Q96JM3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHAMP1Q96JM3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CHAMP1Q96JM3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHAMP1Q96JM3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHAMP1Q96JM3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHAMP1Q96JM3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHAMP1Q96JM3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHAMP1Q96JM3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHAMP1Q96JM3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CHAMP1Q96JM3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHAMP1Q96JM3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHAMP1Q96JM3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHAMP1Q96JM3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHAMP1Q96JM3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHAMP1Q96JM3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHAMP1Q96JM3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHAMP1Q96JM3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHAMP1Q96JM3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHAMP1Q96JM3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHAMP1Q96JM3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHAMP1Q96JM3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHAMP1Q96JM3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHAMP1Q96JM3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHAMP1Q96JM3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHAMP1Q96JM3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHAMP1Q96JM3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHAMP1Q96JM3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHAMP1Q96JM3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHAMP1Q96JM3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHAMP1Q96JM3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CHAMP1Q96JM3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHAMP1Q96JM3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHAMP1Q96JM3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHAMP1Q96JM3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHAMP1Q96JM3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHAMP1Q96JM3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHAMP1Q96JM3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHAMP1Q96JM3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHAMP1Q96JM3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHAMP1Q96JM3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHAMP1Q96JM3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHAMP1Q96JM3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHAMP1Q96JM3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHAMP1Q96JM3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHAMP1Q96JM3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHAMP1Q96JM3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHAMP1Q96JM3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CHAMP1Q96JM3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHAMP1Q96JM3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHAMP1Q96JM3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHAMP1Q96JM3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHAMP1Q96JM3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHAMP1Q96JM3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHAMP1Q96JM3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHAMP1Q96JM3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHAMP1Q96JM3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CHAMP1Q96JM3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHAMP1Q96JM3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHAMP1Q96JM3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHAMP1Q96JM3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CHAMP1Q96JM3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CHAMP1Q96JM3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CHAMP1Q96JM3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHAMP1Q96JM3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHAMP1Q96JM3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHAMP1Q96JM3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHAMP1Q96JM3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHAMP1Q96JM3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHAMP1Q96JM3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHAMP1Q96JM3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHAMP1Q96JM3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CHAMP1Q96JM3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHAMP1Q96JM3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHAMP1Q96JM3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CHAMP1Q96JM3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHAMP1Q96JM3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHAMP1Q96JM3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHAMP1Q96JM3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHAMP1Q96JM3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHAMP1Q96JM3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHAMP1Q96JM3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHAMP1Q96JM3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CHAMP1Q96JM3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHAMP1Q96JM3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CHAMP1Q96JM3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CHAMP1Q96JM3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHAMP1Q96JM3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHAMP1Q96JM3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHAMP1Q96JM3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHAMP1Q96JM3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms