Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT9

IFT43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT43Q96FT9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT43Q96FT9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT43Q96FT9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT43Q96FT9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT43Q96FT9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT43Q96FT9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT43Q96FT9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT43Q96FT9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT43Q96FT9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT43Q96FT9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT43Q96FT9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT43Q96FT9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT43Q96FT9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT43Q96FT9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT43Q96FT9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT43Q96FT9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT43Q96FT9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT43Q96FT9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT43Q96FT9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT43Q96FT9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT43Q96FT9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT43Q96FT9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT43Q96FT9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT43Q96FT9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT43Q96FT9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT43Q96FT9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT43Q96FT9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT43Q96FT9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT43Q96FT9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT43Q96FT9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT43Q96FT9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT43Q96FT9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT43Q96FT9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT43Q96FT9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT43Q96FT9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
IFT43Q96FT9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT43Q96FT9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT43Q96FT9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT43Q96FT9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT43Q96FT9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT43Q96FT9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT43Q96FT9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT43Q96FT9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT43Q96FT9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT43Q96FT9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT43Q96FT9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT43Q96FT9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT43Q96FT9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT43Q96FT9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT43Q96FT9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT43Q96FT9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT43Q96FT9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT43Q96FT9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT43Q96FT9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT43Q96FT9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT43Q96FT9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT43Q96FT9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT43Q96FT9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT43Q96FT9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT43Q96FT9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT43Q96FT9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT43Q96FT9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT43Q96FT9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT43Q96FT9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT43Q96FT9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT43Q96FT9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT43Q96FT9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT43Q96FT9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT43Q96FT9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT43Q96FT9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT43Q96FT9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT43Q96FT9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT43Q96FT9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT43Q96FT9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT43Q96FT9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT43Q96FT9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT43Q96FT9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms