Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ASIC4Q96FT7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ASIC4Q96FT7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ASIC4Q96FT7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ASIC4Q96FT7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ASIC4Q96FT7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ASIC4Q96FT7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ASIC4Q96FT7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ASIC4Q96FT7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ASIC4Q96FT7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ASIC4Q96FT7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ASIC4Q96FT7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ASIC4Q96FT7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ASIC4Q96FT7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ASIC4Q96FT7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ASIC4Q96FT7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ASIC4Q96FT7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ASIC4Q96FT7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ASIC4Q96FT7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ASIC4Q96FT7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ASIC4Q96FT7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ASIC4Q96FT7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ASIC4Q96FT7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ASIC4Q96FT7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ASIC4Q96FT7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ASIC4Q96FT7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ASIC4Q96FT7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ASIC4Q96FT7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ASIC4Q96FT7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ASIC4Q96FT7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ASIC4Q96FT7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ASIC4Q96FT7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ASIC4Q96FT7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ASIC4Q96FT7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ASIC4Q96FT7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ASIC4Q96FT7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ASIC4Q96FT7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ASIC4Q96FT7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ASIC4Q96FT7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ASIC4Q96FT7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASIC4Q96FT7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASIC4Q96FT7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASIC4Q96FT7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASIC4Q96FT7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASIC4Q96FT7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ASIC4Q96FT7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ASIC4Q96FT7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ASIC4Q96FT7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ASIC4Q96FT7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ASIC4Q96FT7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ASIC4Q96FT7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ASIC4Q96FT7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ASIC4Q96FT7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ASIC4Q96FT7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ASIC4Q96FT7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ASIC4Q96FT7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ASIC4Q96FT7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ASIC4Q96FT7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ASIC4Q96FT7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ASIC4Q96FT7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ASIC4Q96FT7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ASIC4Q96FT7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ASIC4Q96FT7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ASIC4Q96FT7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ASIC4Q96FT7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ASIC4Q96FT7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms